RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 EDNRAP25101 427 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 TAS2R43P59537 309 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 GPR176Q14439 515 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 CDK5R1Q15078 307 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 ZMYND11Q15326 602 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 FCN2Q15485 313 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 OTPQ5XKR4 325 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 WBP2NLQ6ICG8 309 aa11.71□□□□□ -0.53
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PRAME-213ENST00000492657 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 ABHD1Q96SE0 405 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-213ENST00000492657 CEP192Q8TEP8 1941 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa11.71□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 SLC43A1O75387 559 aa11.71□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 DDAH2O95865 285 aa11.71□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.71□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 PDGFAP04085 211 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 HRGP04196 525 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 CD53P19397 219 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 RAB3BP20337 219 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 GRK6P43250 576 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 CTXN1P60606 82 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.541e-7■■■■□ 20.2
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PRAME-213ENST00000492657 RIN1Q13671 783 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 NANSQ9NR45 359 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ARPC3O15145 178 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 TSPAN9O75954 239 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 MAB21L1Q13394 359 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 GGTLC2Q14390 218 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 MS4A15Q8N5U1 240 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 POMGNT2Q8NAT1 580 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ZNF563Q8TA94 476 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ZNF721Q8TF20 911 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ADIPOR1Q96A54 375 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 MESP1Q9BRJ9 268 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 ALG12Q9BV10 488 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 MGAT4AQ9UM21 535 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-213ENST00000492657 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 TVP23AA6NH52 213 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 IGKV3-11P04433 115 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 FCER2P06734 321 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 CXCL3P19876 107 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 RORAP35398 523 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 RPS27P42677 84 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-213ENST00000492657 LGALS3BPQ08380 585 aa11.69□□□□□ -0.54
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