RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 SEMA4FO95754 770 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 GOT2P00505 430 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 HCKP08631 526 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 FCGR3AP08637 254 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 PSMC3P17980 439 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 PPP2R1BP30154 601 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ALDH3A1P30838 453 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 UGT1A5P35504 534 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 PTGFRP43088 359 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 MAGEA2P43356 314 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 CAPZBP47756 277 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 NPBWR2P48146 333 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 GABRA4P48169 554 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 GSK3BP49841 420 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 PRELPP51888 382 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 UCNP55089 124 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 RAG2P55895 527 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 UBE2G2P60604 165 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 SPCS3P61009 180 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 NAAAQ02083 359 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 IRF8Q02556 426 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ZNF33AQ06730 810 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 FCHO2Q0JRZ9 810 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 STX3Q13277 289 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 CRMP1Q14194 572 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 GANABQ14697 944 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 CHRFAM7AQ494W8 412 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 SBK1Q52WX2 424 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 DUPD1Q68J44 220 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ZNF343Q6P1L6 599 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 C1orf94Q6P1W5 598 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 EMBQ6PCB8 327 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 CLEC18BQ6UXF7 455 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 GCNT7Q6ZNI0 430 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 MOB2Q70IA6 237 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 C16orf62Q7Z3J2 963 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 C4orf32Q8N8J7 132 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 CYB561A3Q8NBI2 242 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 OR5T3Q8NGG3 340 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 GIPC3Q8TF64 312 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ST8SIA1Q92185 356 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 GTF2H4Q92759 462 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 NAT6Q93015 286 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 BIRC7Q96CA5 298 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 CPB2Q96IY4 423 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 CEP170P1Q96L14 293 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 TSSK3Q96PN8 268 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 CTRCQ99895 268 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ZNF251Q9BRH9 671 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 NAT9Q9BTE0 207 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 GPR174Q9BXC1 333 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 SLC22A4Q9H015 551 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 RACGAP1Q9H0H5 632 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 OR51B6Q9H340 312 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 NARFLQ9H6Q4 476 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ALG9Q9H6U8 611 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 LPAR2Q9HBW0 351 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 MYOZ2Q9NPC6 264 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 UFSP2Q9NUQ7 469 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 PHF11Q9UIL8 331 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 SLC22A13Q9Y226 551 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 TNRQ92752 1358 aa2.85□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 A0A1W2PNV4 684 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 A0A1W2PPR1 153 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ZNF840PA6NDX5 716 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 SMIM23A6NLE4 172 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 E7EWF7 191 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 NPIPA7E9PJI5 369 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 SDHDO14521 159 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 RAB29O14966 203 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ZSCAN12O43309 604 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 OR10H3O60404 316 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 DEXIO95424 95 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 SERPIND1P05546 499 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 NPIPA8P0DM63 369 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 COX5BP10606 129 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 ACADSP16219 412 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 MMP11P24347 488 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 STOMP27105 288 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 HSD11B1P28845 292 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 SAA4P35542 130 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 PCK1P35558 622 aa2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 CDK9P50750 372 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PHC3-211ENST00000486042 RPL14P50914 215 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms