RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 FN3KRPQ9HA64 309 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PALMDQ9NP74 551 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CNIH4Q9P003 139 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJB9Q9UBS3 223 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PNV4 684 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 OR51F1A6NGY5 319 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF860A6NHJ4 632 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 E5RI56 91 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GFYI3L273 518 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 K7EPI3 171 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 M0QX08 132 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RAB27BO00194 218 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CDC7O00311 574 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NR5A2O00482 541 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 OR7A17O14581 309 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CHST10O43529 356 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ACTL6AO96019 429 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 KRT6AP02538 564 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 KRT6BP04259 564 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 C8GP07360 202 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NGFRP08138 427 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 HSD3B1P14060 373 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 MAOAP21397 527 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 DCKP27707 260 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RYKP34925 604 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 KRT6CP48668 564 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GPR143P51810 404 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PGGT1BP53609 377 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 AP1S2P56377 157 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GABARAPL2P60520 117 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 UFM1P61960 85 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CSNK2BP67870 215 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SIRPAP78324 504 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CHRNB3Q05901 458 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TRAF3Q13114 568 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GTF2H2Q13888 395 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 AP5B1Q2VPB7 878 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CYBRD1Q53TN4 286 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PAGE3Q5JUK9 113 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GLYATQ6IB77 296 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NIPAL1Q6NVV3 410 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CYP20A1Q6UW02 462 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ENPP6Q6UWR7 440 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 QSOX2Q6ZRP7 698 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 USP43Q70EL4 1123 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 FAM57BQ71RH2 274 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PLD3Q8IV08 490 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CBR4Q8N4T8 237 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RNF148Q8N7C7 305 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 OR9I1Q8NGQ6 314 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 C10orf105Q8TEF2 133 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SMPDL3AQ92484 453 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GTF2H4Q92759 462 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF566Q969W8 418 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RHBDF1Q96CC6 855 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 STARD4Q96DR4 205 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 LINGO1Q96FE5 620 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R36Q96LQ0 422 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CNBD2Q96M20 576 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NSMCE2Q96MF7 247 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 DOHHQ9BU89 302 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CHID1Q9BWS9 393 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RHBGQ9H310 441 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CD274Q9NZQ7 290 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SNX8Q9Y5X2 465 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 A0A096LPI6 279 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 FAM220BPB1ANY3 271 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 H3BSA7 217 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 UPK1AO00322 258 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TAPBPO15533 448 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TIPRLO75663 272 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 STK16O75716 305 aa5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms