RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 PHYHD1Q5SRE7 291 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf140Q5VVS0 124 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 SAXO2Q658L1 398 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD46Q86W74 232 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 GPR137CQ8N3F9 429 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 RAB39BQ96DA2 213 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 MED29Q9NX70 200 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 RCE1Q9Y256 329 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF281Q9Y2X9 895 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV2-5P01817 119 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 TFPTP0C1Z6 253 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 GKN3PP0CG01 181 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CD79AP11912 226 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 UQCRBP14927 111 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN8P56748 225 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 HPCAP84074 193 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 DOK3Q7L591 496 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC36Q8IYA8 594 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CADM2Q8N3J6 435 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 SLITRK2Q9H156 845 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 RLIMQ9NVW2 624 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 SEC14L4Q9UDX3 406 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PPW3 197 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 HMGN4O00479 90 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM13O60858 407 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 NPIPB7O75200 414 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 PNMTP11086 282 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 IL7RP16871 459 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF43P17038 809 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 IL13RA1P78552 427 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CCL8P80075 99 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 GSG1Q2KHT4 349 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 FTCDNL1E5RQL4 147 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 OCLNQ16625 522 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 NEURL3Q96EH8 262 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 B3GAT1Q9P2W7 334 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF69Q9UC07 566 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 C17orf100A8MU93 164 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 M0R3G1 203 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 COPEO14579 308 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CLPTM1O96005 669 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 MDKP21741 143 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 GATA3P23771 443 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CRYBB2P43320 205 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 RPS23P62266 143 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 GALK2Q01415 458 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 BAMBIQ13145 260 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 NKPD1Q17RQ9 610 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 HOMEZQ8IX15 550 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 OR8J2Q8NGG1 315 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD8Q8NHS3 518 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 TUBGCP3Q96CW5 907 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 OXGR1Q96P68 337 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN32Q96QS1 320 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 OR2M2Q96R28 347 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 PTDSS2Q9BVG9 487 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 DPY30Q9C005 99 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF224Q9NZL3 707 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CACNG2Q9Y698 323 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 NPHS1O60500 1241 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 AHSA1O95433 338 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 DBIP07108 87 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 PRG2P13727 222 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 RAD52P43351 418 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 AQP5P55064 265 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 LCN2P80188 198 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 GNA13Q14344 377 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 CHI3L2Q15782 390 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ATG16L1Q676U5 607 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF440Q8IYI8 595 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM123Q8N131 208 aa16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms