RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SHC1P29353 583 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 GAB1Q13480 694 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF679Q8IYX0 411 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PSD2Q9BQI7 771 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM30AQ9NV96 361 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PEX14O75381 377 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 NCR1O76036 304 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 CBX7O95931 251 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM23P36406 574 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 OR5M11Q96RB7 305 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A31Q9H0C2 315 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SDHAF2Q9NX18 166 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MUTYHQ9UIF7 546 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SNX11Q9Y5W9 270 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 HOXB5P09067 269 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN12P56749 244 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PIGQQ9BRB3 760 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PPA2Q9H2U2 334 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D29Q9UFV1 150 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MMP17Q9ULZ9 603 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ITGB2P05107 769 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A12P48065 614 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF136P52737 540 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R16Q9NYV7 291 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 OSGIN1Q9UJX0 560 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PPT2Q9UMR5 302 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF10AO00220 468 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 LILRB5O75023 590 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 GABARAPO95166 117 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MMP11P24347 488 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PGFP49763 221 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TNK1Q13470 666 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MSMO1Q15800 293 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SLC36A2Q495M3 483 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 NKAIN2Q5VXU1 208 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF511Q8NB15 262 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM185AQ8NFB2 350 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MIB2Q96AX9 1013 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 RAB3CQ96E17 227 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 KCND3Q9UK17 655 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM82A0PJX8 343 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PRRT4C9JH25 899 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 B3GALT4O96024 378 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 FCGR2AP12318 317 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 GDNFP39905 211 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP6Q16828 381 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF546Q86UE3 836 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 LAX1Q8IWV1 398 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 LGALS14Q8TCE9 139 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MCOLN1Q9GZU1 580 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA4GQ9NTN9 838 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MT-ATP6P00846 226 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 COMTD1Q86VU5 262 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 LIN7BQ9HAP6 207 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 DYNLRB1Q9NP97 96 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SLAMF7Q9NQ25 335 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ALOX12BO75342 701 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 NID1P14543 1247 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 VEGFCP49767 419 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 RPS18P62269 152 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MEP1BQ16820 701 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35D3Q5M8T2 416 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 OR52I1Q8NGK6 324 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PFDN5Q99471 154 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 LHX6Q9UPM6 363 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 EMC9Q9Y3B6 208 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MYH4Q9Y623 1939 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MCRIP1C9JLW8 97 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 CD1CP29017 333 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 NGBQ9NPG2 151 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB10Q9UN67 800 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ALS2Q96Q42 1657 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 NWD2Q9ULI1 1742 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 AGPAT2O15120 278 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP5Q16690 384 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 GPR155Q7Z3F1 870 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 GON7Q9BXV9 100 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SURF4O15260 269 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF749O43361 778 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 NPSR1Q6W5P4 371 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A23A1A5C7 686 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf196B1AJZ1 125 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms