RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264039.6

GPC1-201, Transcript of glypican 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-201ENST00000264039 BPTFQ12830 3046 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 SBF1O95248 1867 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 CSF1P09603 554 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ELNP15502 786 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 RAG2P55895 527 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 FKBP1BP68106 108 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 PDE7AQ13946 482 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 B4GALT2O60909 372 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 OR4E1P0C645 316 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 S100A12P80511 92 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 NAXDQ8IW45 347 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ACBD4Q8NC06 268 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 OR2L2Q8NH16 312 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ELP5Q8TE02 316 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 YKT6O15498 198 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 PTAFRP25105 342 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 SSX2Q16385 188 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 EIPR1Q53HC9 387 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ABHD13Q7L211 337 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 APMAPQ9HDC9 416 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 PLPP2O43688 288 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 POU3F4P49335 361 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 CDK5R1Q15078 307 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 MYADMQ96S97 322 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 INTS14Q96SY0 518 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 S100A13Q99584 98 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ZNF649Q9BS31 505 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 MED17Q9NVC6 651 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 OR6C76A6NM76 312 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 PEX12O00623 359 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 HPP00738 406 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 SPI1P17947 270 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 PI3P19957 117 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 THBS2P35442 1172 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 SPICQ8N5J4 248 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 OR4S1Q8NGB4 309 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 MAP3K3Q99759 626 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 PRO1933Q9H354 126 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 SMCO4Q9NRQ5 59 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 FAM186AA6NE01 2351 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 STMND1H3BQB6 276 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 EOMESO95936 686 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 IFNA4P05014 189 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 RNF224P0DH78 156 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 CTAG1AP78358 180 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 OR7G2Q8NG99 324 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 SMIM19Q96E16 107 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 C11orf98E9PRG8 122 aa14.97□□□□□ -0.01
GPC1-201ENST00000264039 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms