RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 DPPA4Q7L190 304 aa6.63□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 IL17FQ96PD4 163 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MS4A8Q9BY19 250 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SLITRK2Q9H156 845 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 C1orf198Q9H425 327 aa6.63□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.62□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 FUT10Q6P4F1 479 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ABHD13Q7L211 337 aa6.62□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 CDK20Q8IZL9 346 aa6.62□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 OR2T27Q8NH04 317 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR51A7Q8NH64 312 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 EDAQ92838 391 aa6.62□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.62□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 AGAP20933 346 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CPT2P23786 658 aa6.62□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 EPHB3P54753 998 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 STARD6P59095 220 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 LMAN2Q12907 356 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PLA2G7Q13093 441 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 LIPNQ5VXI9 398 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR52W1Q6IF63 320 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.62□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.62□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 TMED6Q8WW62 240 aa6.62□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 XKR8Q9H6D3 395 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM100Q9NV29 134 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CLDND1Q9NY35 253 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 A0A1B0GV90 55 aa6.61□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NDUFS4O43181 175 aa6.61□□□□□ -1.35
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