RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tceal1Q921P9 165 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep41Q99NF3 373 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf115Q9D0C1 305 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IkbipQ9DBZ1 373 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sacm1lQ9EP69 587 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Jph1Q9ET80 660 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cln8Q9QUK3 288 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dach1Q9QYB2 751 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fads2Q9Z0R9 444 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd320Q9Z1P5 260 aa9.9□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv3-4A0A0A6YXF1 117 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 E030025P04RikA2A6V5 185 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6710A2ART0 554 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r98E9PZ56 857 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5407E9Q7Q1 248 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp616J3QN14 987 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm19965J3QNY8 723 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr889L7N1Y6 314 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc10a1O08705 362 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nfatc1O88942 717 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sox6P40645 827 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 S1pr2P52592 352 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ArntP53762 791 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Idh2P54071 452 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cct7P80313 544 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 F13bQ07968 669 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trappc13Q3TIR1 417 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd28Q505D1 1053 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rtp3Q5QGU6 474 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NkaplQ5SZT7 395 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr34Q5U4F6 535 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam26bQ6IMH6 699 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl9Q6ZPT1 617 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpatch2Q7TQC7 527 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr506Q7TRU6 314 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pgm2Q7TSV4 620 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smim37Q8BT35 56 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ythdf3Q8BYK6 585 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LaynQ8C351 381 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lin52Q8CD94 116 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rmnd1Q8CI78 450 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Katnal1Q8K0T4 488 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r42Q8VBS7 329 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr186Q8VEX5 309 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1423Q8VFV0 310 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr922Q8VG50 311 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrgpra1Q91WW5 304 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdhac1Q91Y10 964 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Diras1Q91Z61 198 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pacsin3Q99JB8 424 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q99K99 313 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bhlhe41Q99PV5 410 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pgpep1lQ9CWB5 130 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zdhhc21Q9D270 265 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdkl2Q9QUK0 568 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slurp1Q9Z0K7 110 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NacaP70670 2187 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm34653A0A1L1SR01 368 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rap1gds1E9Q912 607 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc7bE9Q9Y3 381 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r121K7N6J4 314 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FxnO35943 207 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec2lP0C7M9 211 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccnd1P25322 295 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mbl1P39039 239 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccr4P51680 360 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-Q6P79568 326 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SgcbP82349 320 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serping1P97290 504 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MeikinQ5F2C3 434 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csnk2a1Q60737 391 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Capn11Q6J756 714 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P4ha3Q6W3F0 542 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hapln3Q80WM5 359 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 JkampQ8BI36 311 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MkxQ8BIA3 353 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dlec1Q8BLA1 635 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec9aQ8BRU4 238 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pik3cbQ8BTI9 1064 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elfn1Q8C8T7 828 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr37Q8CBE3 496 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc43a2Q8CGA3 568 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acsm2Q8K0L3 575 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctxn1Q8K129 82 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc35a3Q8R1T4 326 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r75Q8R289 305 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Agr3Q8R3W7 165 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptov1Q91VU8 416 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spef1Q99JL1 234 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arl5bQ9D4P0 179 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chst1Q9EQC0 411 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fezf2Q9ESP5 455 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slco1b2Q9JJL3 689 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FancmQ8BGE5 2021 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-54A0A075B5W5 117 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv4-63A0A0G2JFU6 117 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.8 ms