Protein–RNA interactions for Protein: Q8R289

Vmn1r75, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r75Q8R289 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Vmn1r75Q8R289 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Vmn1r75Q8R289 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Vmn1r75Q8R289 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Vmn1r75Q8R289 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Vmn1r75Q8R289 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Vmn1r75Q8R289 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Vmn1r75Q8R289 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Vmn1r75Q8R289 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Vmn1r75Q8R289 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vmn1r75Q8R289 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Vmn1r75Q8R289 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vmn1r75Q8R289 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Vmn1r75Q8R289 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vmn1r75Q8R289 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Vmn1r75Q8R289 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vmn1r75Q8R289 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vmn1r75Q8R289 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vmn1r75Q8R289 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Vmn1r75Q8R289 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vmn1r75Q8R289 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vmn1r75Q8R289 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vmn1r75Q8R289 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vmn1r75Q8R289 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vmn1r75Q8R289 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vmn1r75Q8R289 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vmn1r75Q8R289 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Vmn1r75Q8R289 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vmn1r75Q8R289 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vmn1r75Q8R289 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vmn1r75Q8R289 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vmn1r75Q8R289 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Vmn1r75Q8R289 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vmn1r75Q8R289 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vmn1r75Q8R289 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vmn1r75Q8R289 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vmn1r75Q8R289 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vmn1r75Q8R289 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vmn1r75Q8R289 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vmn1r75Q8R289 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vmn1r75Q8R289 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vmn1r75Q8R289 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vmn1r75Q8R289 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Vmn1r75Q8R289 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Vmn1r75Q8R289 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vmn1r75Q8R289 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vmn1r75Q8R289 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Vmn1r75Q8R289 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vmn1r75Q8R289 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vmn1r75Q8R289 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vmn1r75Q8R289 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vmn1r75Q8R289 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vmn1r75Q8R289 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vmn1r75Q8R289 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vmn1r75Q8R289 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vmn1r75Q8R289 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Vmn1r75Q8R289 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vmn1r75Q8R289 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r75Q8R289 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vmn1r75Q8R289 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Vmn1r75Q8R289 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vmn1r75Q8R289 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vmn1r75Q8R289 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vmn1r75Q8R289 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vmn1r75Q8R289 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vmn1r75Q8R289 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vmn1r75Q8R289 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r75Q8R289 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vmn1r75Q8R289 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vmn1r75Q8R289 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r75Q8R289 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vmn1r75Q8R289 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vmn1r75Q8R289 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vmn1r75Q8R289 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vmn1r75Q8R289 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vmn1r75Q8R289 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vmn1r75Q8R289 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Vmn1r75Q8R289 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vmn1r75Q8R289 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vmn1r75Q8R289 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vmn1r75Q8R289 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Vmn1r75Q8R289 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn1r75Q8R289 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vmn1r75Q8R289 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn1r75Q8R289 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vmn1r75Q8R289 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vmn1r75Q8R289 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r75Q8R289 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r75Q8R289 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r75Q8R289 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r75Q8R289 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r75Q8R289 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vmn1r75Q8R289 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r75Q8R289 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r75Q8R289 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r75Q8R289 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vmn1r75Q8R289 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vmn1r75Q8R289 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vmn1r75Q8R289 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn1r75Q8R289 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms