RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PNR3 127 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 J3QLW9 94 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 DCTN6O00399 190 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 GPANK1O95872 356 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 DLGAP3O95886 979 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SBK2P0C263 348 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 HLA-DOBP13765 273 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ZNF19P17023 458 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PTGDSP41222 190 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ATP1A4Q13733 1029 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 MELKQ14680 651 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 RPTNQ6XPR3 784 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ATCAYQ86WG3 371 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ESX1Q8N693 406 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PRSS33Q8NF86 280 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ALG8Q9BVK2 526 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ASPNQ9BXN1 380 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 IRGMA1A4Y4 181 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SLC35F4A4IF30 521 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TVP23AA6NH52 213 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 J3QRK9 145 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 EFNA2O43921 213 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SELENOFO60613 162 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CLPXO76031 633 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TGM1P22735 817 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 DNASE1L1P49184 302 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 OR12D2P58182 307 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SNTA1Q13424 505 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 C22orf42Q6IC83 251 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SSX6Q7RTT6 188 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 GPAT4Q86UL3 456 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SYT14Q8NB59 555 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 M1APQ8TC57 530 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 NXPE2Q96DL1 559 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 C5orf34Q96MH7 638 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PTGES2Q9H7Z7 377 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 FKRPQ9H9S5 495 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 MGAQ8IWI9 3026 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CCDC182A6NF36 153 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 XKRYO14609 159 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 RAD1O60671 282 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 AKR7A3O95154 331 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 HLA-DQA2P01906 255 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 BGLAPP02818 100 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SPI1P17947 270 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ITGA3P26006 1051 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SDHAP31040 664 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TGM4P49221 684 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PSPHP78330 225 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 GABREP78334 506 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ACKR1Q16570 336 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 SLC22A10Q63ZE4 541 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 OR5J2Q8NH18 312 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 C4orf36Q96KX1 117 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 OR5B2Q96R09 309 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 STMN3Q9NZ72 180 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TMEM129A0AVI4 362 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 A6NL46 340 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 E9PI62 339 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 STMND1H3BQB6 276 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 ARPC3O15145 178 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 UQCRC1P31930 480 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 RFC3P40938 356 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 BMXP51813 675 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-215ENST00000549143 TLE3Q04726 772 aa7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms