RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, human

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1B-208	ENST00000515588	UPB1	Q9UBR1	384 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588		A0A1W2PR80	420 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	CIB4	A0PJX0	185 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	DPRX	A6NFQ7	191 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	MS4A18	H0YCH9	400 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	NME4	O00746	187 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF432	O94892	652 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	OR1E2	P47887	323 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC7A2	P52569	658 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	LIPE	Q05469	1076 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	LINGO2	Q7L985	606 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	OR52N5	Q8NH56	324 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	PROX1	Q92786	737 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	OXGR1	Q96P68	337 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	EPYC	Q99645	322 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	BAG5	Q9UL15	447 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	UPK3A	O75631	287 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	HLA-DOB	P13765	273 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF43	P17038	809 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	MPG	P29372	298 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	NUDT2	P50583	147 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	CLDN17	P56750	224 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	NIPAL3	Q6P499	406 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	WDR31	Q8NA23	367 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	NEUROG1	Q92886	237 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	MUCL1	Q96DR8	90 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	NGB	Q9NPG2	151 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	IFNA14	P01570	189 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	GSK3B	P49841	420 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC25A3	Q00325	362 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	DEF8	Q6ZN54	512 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	SCAI	Q8N9R8	606 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	RCE1	Q9Y256	329 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	ACAN	P16112	2415 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	MTOR	P42345	2549 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	ARID1A	O14497	2285 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	PLPP3	O14495	311 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	HS3ST1	O14792	307 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	CLOCK	O15516	846 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	CD3E	P07766	207 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	FUT4	P22083	530 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	PRDX6	P30041	224 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	SELENOW	P63302	87 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	PMS2P3	Q13401	168 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF74	Q16587	644 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	TPD52L3	Q96J77	140 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	MPP4	Q96JB8	637 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	ASPN	Q9BXN1	380 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERF1B-208	ENST00000515588	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.81	□□□□□ -0.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms