RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492417.5

TRA2B-215, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 1 (best)

Gene TRA2B, Length 4,141 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC39A7	Q92504	469 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	UFD1	Q92890	307 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	FEV	Q99581	238 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	UCK2	Q9BZX2	261 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PCDH17	O14917	1159 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CXCL13	O43927	109 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TOX	O94900	526 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	HP	P00738	406 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TFAP2A	P05549	437 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	NAT2	P11245	290 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	RHCE	P18577	417 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	GCGR	P47871	477 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC6A8	P48029	635 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CARD18	P57730	90 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	VLDLR	P98155	873 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PIGF	Q07326	219 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	VEZF1	Q14119	521 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	AICDA	Q9GZX7	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417		U3KQA8	63 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417		A0A087WV62	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417		H7C1C5	153 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417		M0R129	80 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	DPM1	O60762	260 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	AKR7A3	O95154	331 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PTTG1	O95997	202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CD96	P40200	585 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	LCN6	P62502	163 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ERVK-25	P63136	954 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	GALK2	Q01415	458 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	IL10RA	Q13651	578 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SPERT	Q8NA61	448 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	THEM6	Q8WUY1	208 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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