RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486234.1

AUP1-208, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, human

TSL 5

Gene AUP1, Length 984 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AUP1-208	ENST00000486234	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
AUP1-208	ENST00000486234	REEP1	Q9H902	201 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AUP1-208	ENST00000486234	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AUP1-208	ENST00000486234	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AUP1-208	ENST00000486234	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AUP1-208	ENST00000486234	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
AUP1-208	ENST00000486234	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
AUP1-208	ENST00000486234	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AUP1-208	ENST00000486234	TNFRSF11B	O00300	401 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	DIRAS1	O95057	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	CST1	P01037	141 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	CGA	P01215	116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	IFI30	P13284	250 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	LIMS1	P48059	325 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	PRPS1	P60891	318 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	BEND4	Q6ZU67	534 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	GPAT4	Q86UL3	456 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	OR52J3	Q8NH60	311 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	PFN4	Q8NHR9	129 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	RCE1	Q9Y256	329 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	AP4S1	Q9Y587	144 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234		A8MXE2	369 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	MS4A18	H0YCH9	400 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	GNGT2	O14610	69 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	TSPAN19	P0C672	248 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	ADORA3	P0DMS8	318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	OR3A2	P47893	321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	ARHGDIA	P52565	204 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	OAF	Q86UD1	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	KIF18B	Q86Y91	864 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	UEVLD	Q8IX04	471 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	APH1A	Q96BI3	265 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	CLOCK	O15516	846 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	OR10H3	O60404	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55	7e-18	■■■□□ 18
AUP1-208	ENST00000486234	CCNB2	O95067	398 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	AHCY	P23526	432 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	OMP	P47874	163 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	SIRPA	P78324	504 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	IL1RL1	Q01638	556 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	CCNI	Q14094	377 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	P2RY6	Q15077	328 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	MICA	Q29983	383 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	VWA1	Q6PCB0	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	AAED1	Q7RTV5	226 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AUP1-208	ENST00000486234	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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