RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	SCARB2	Q14108	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	GABRA6	Q16445	453 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	THTPA	Q9BU02	230 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	COL6A5	A8TX70	2615 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ATR	Q13535	2644 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028		E7EQL1	145 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	FAAH	O00519	579 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	GMNN	O75496	209 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	TFPT	P0C1Z6	253 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ARAF	P10398	606 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A16	P16260	332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	IL7R	P16871	459 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CCNA2	P20248	432 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC1A3	P43003	542 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	GSK3B	P49841	420 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CRISP3	P54108	245 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	H3F3A	P84243	136 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ZSCAN26	Q16670	478 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CCDC103	Q8IW40	242 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	FBN3	Q75N90	2809 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ABCA1	O95477	2261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	AGAP5	A6NIR3	686 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028		H7C417	338 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	AP3D1	O14617	1153 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	WNT11	O96014	354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ITGA5	P08648	1049 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CSF3	P09919	207 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	PTN	P21246	168 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	NCALD	P61601	193 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	RBBP4	Q09028	425 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	VMAC	Q2NL98	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	REEP3	Q6NUK4	255 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	PTOV1	Q86YD1	416 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	MICU2	Q8IYU8	434 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	HIPK4	Q8NE63	616 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	USP22	Q9UPT9	525 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A0G2JPF8	293 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A1W2PR80	420 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM72	A0PK05	275 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG11-208	ENST00000437028	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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