RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 SLC7A2P52569 658 aa22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 LIPEQ05469 1076 aa22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 SPNS3Q6ZMD2 512 aa22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 DEF8Q6ZN54 512 aa22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 SSX8Q7RTT4 187 aa22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 OR6S1Q8NH40 331 aa22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 ALPK1Q96QP1 1244 aa22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 CCL19Q99731 98 aa22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 MYLK2Q9H1R3 596 aa22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22.42■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 DYNC1I1O14576 645 aa22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 GSTA4O15217 222 aa22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 BGLAPP02818 100 aa22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 HOXC12P31275 282 aa22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 PMS2P3Q13401 168 aa22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 GABRA6Q16445 453 aa22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 CYBRD1Q53TN4 286 aa22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 NCMAPQ5T1S8 102 aa22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 C20orf204Q6ZNR8 217 aa22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 RNF115Q9Y4L5 304 aa22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 DSCAMO60469 2012 aa22.41■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 A0A1W2PR80 420 aa22.4■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 MPGP29372 298 aa22.4■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 OR1E2P47887 323 aa22.4■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 TAS2R41P59536 307 aa22.4■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 BSPH1Q075Z2 132 aa22.4■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 PIGTQ969N2 578 aa22.4■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 SLC41A3Q96GZ6 507 aa22.4■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 MOGAT1Q96PD6 335 aa22.4■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 PCDHAC1Q9H158 963 aa22.4■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
CTXN1-201ENST00000318978 OR6C65A6NJZ3 312 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF587BE7ETH6 402 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 LRRN3E7EW58 273 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 PDLIM1O00151 329 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 LTBQ06643 244 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 LGALS3BPQ08380 585 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 LINC00114Q6XXX2 140 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 HACD2Q6Y1H2 254 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 WDR88Q6ZMY6 472 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 UEVLDQ8IX04 471 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 SCAIQ8N9R8 606 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 LZICQ8WZA0 190 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 MPP4Q96JB8 637 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 MUS81Q96NY9 551 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 CXXC4Q9H2H0 198 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 ALG2Q9H553 416 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 B3GAT1Q9P2W7 334 aa22.39■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 NME4O00746 187 aa22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 NDUFAB1O14561 156 aa22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 FZD7O75084 574 aa22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 SLC43A1O75387 559 aa22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 OR6A2O95222 327 aa22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 THY1P04216 161 aa22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 PRDX6P30041 224 aa22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF83P51522 516 aa22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 KLHL17Q6TDP4 642 aa22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM204Q9BSN7 226 aa22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 RCE1Q9Y256 329 aa22.38■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 DPRXA6NFQ7 191 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 MS4A18H0YCH9 400 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 HS3ST1O14792 307 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 SMPD2O60906 423 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 CH25HO95992 272 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 MT-ATP6P00846 226 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 AHCYP23526 432 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 SELENOWP63302 87 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 MS4A18Q3C1V0 323 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 HMBOX1Q6NT76 420 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 KLHL24Q6TFL4 600 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 C17orf78Q8N4C9 275 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 NPAP1Q9NZP6 1156 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 SLC25A15Q9Y619 301 aa22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 CXCR6O00574 342 aa22.36■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 UPK3AO75631 287 aa22.36■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 SERPINI2O75830 405 aa22.36■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 LYPD3O95274 346 aa22.36■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF682O95780 498 aa22.36■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 HIST1H2ABP04908 130 aa22.36■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 ADORA3P0DMS8 318 aa22.36■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 UMPSP11172 480 aa22.36■■□□□ 1.17
CTXN1-201ENST00000318978 GSK3BP49841 420 aa22.36■■□□□ 1.17
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