RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 TSPAN32Q96QS1 320 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM36Q9NQ86 728 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 GRHPRQ9UBQ7 328 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 NOX1Q9Y5S8 564 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 WIF1Q9Y5W5 379 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 AHSA1O95433 338 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 CELA2AP08217 269 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 FABP5Q01469 135 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 INAQ16352 499 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 OR5J2Q8NH18 312 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TAAR9Q96RI9 348 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 COQ7Q99807 217 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PQ72 361 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TFP02787 698 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 CAPZA2P47755 286 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 VASNQ6EMK4 673 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 OR11G2Q8NGC1 345 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 OR6S1Q8NH40 331 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 ZNRF4Q8WWF5 429 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A36Q96CQ1 311 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 KCTD7Q96MP8 289 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 DDA1Q9BW61 102 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 FAM86C1Q9NVL1 165 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TAS2R5Q9NYW4 299 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 PADI1Q9ULC6 663 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 HRH3Q9Y5N1 445 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 OR2T7P0C7T2 308 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 EXD3Q8N9H8 876 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 OR2T27Q8NH04 317 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJA3Q96EY1 480 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 OR11A1Q9GZK7 315 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 PARD6AQ9NPB6 346 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 PISDQ9UG56 409 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 C4orf47A7E2U8 309 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 OR2T1O43869 369 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ITGA10O75578 1167 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 GLCEO94923 617 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 IL1AP01583 271 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 MESTQ5EB52 335 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CDCP2Q5VXM1 449 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ARSKQ6UWY0 536 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SLC35F2Q8IXU6 374 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 NUAK2Q9H093 628 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 RERGLQ9H628 205 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 PEX16Q9Y5Y5 336 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 A0A075B6Q4 140 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 DLGAP3O95886 979 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 HLA-DPB1P04440 258 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 GRPRP30550 384 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFAF7Q7L592 441 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 BTLAQ7Z6A9 289 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 OR6K6Q8NGW6 343 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 C4orf36Q96KX1 117 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 NPAS1Q99742 590 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 TMED9Q9BVK6 235 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SNTG1Q9NSN8 517 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 PMS2P1A4D2B8 440 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 TP53I11O14683 189 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CDRT1O95170 752 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 S100A5P33763 92 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CASP3P42574 277 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 RORCP51449 518 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 TAS2R43P59537 309 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 FOXF1Q12946 379 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CSRP2Q16527 193 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 LINC01590Q5TEZ4 76 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SSX6Q7RTT6 188 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 PRRX2Q99811 253 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 MED18Q9BUE0 208 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 INIPQ9NRY2 104 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 NCDNQ9UBB6 729 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 MOKQ9UQ07 419 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 VDAC3Q9Y277 283 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 RNF13O43567 381 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 DXOO77932 396 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 JMJD7P0C870 316 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 GALP22466 123 aa24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms