RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35D2Q76EJ3 337 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OLIG1Q8TAK6 271 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 RHBDD1Q8TEB9 315 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 HRH4Q9H3N8 390 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SOCS6O14544 535 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ISL1P61371 349 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9A3R2Q15599 337 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 LYSMD2Q8IV50 215 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 IL1F10Q8WWZ1 152 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 RAB3CQ96E17 227 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 COPS3Q9UNS2 423 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 WIF1Q9Y5W5 379 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ABLIM3O94929 683 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OPN1LWP04000 364 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PXNP49023 591 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PIGCQ92535 297 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 FRZBQ92765 325 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SLC46A1Q96NT5 459 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SLC38A1Q9H2H9 487 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 K7EPK0 472 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CD14P08571 375 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35D3Q5M8T2 416 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PLPP6Q8IY26 295 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01465Q8N7H1 131 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR5H6Q8NGV6 325 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM255BQ8WV15 326 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 UBQLN3Q9H347 655 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 H3BQ06 376 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 VEGFCP49767 419 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MANEAQ5SRI9 462 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 BORCS7Q96B45 105 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LIN7BQ9HAP6 207 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CCL26Q9Y258 94 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TOR1AO14656 332 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 FABP7O15540 132 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SULT1B1O43704 296 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PIPP12273 146 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM23P36406 574 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC26Q2I0M4 334 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TMEFF1Q8IYR6 380 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 EID2Q8N6I1 236 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC1AQ8NC01 280 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MUTYHQ9UIF7 546 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CA5BQ9Y2D0 317 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 OR4D6Q8NGJ1 314 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SGK3Q96BR1 496 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SDHAF2Q9NX18 166 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 RPS18P62269 152 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PSMF1Q92530 271 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K3Q99759 626 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT22Q9BRQ3 303 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MMACHCQ9Y4U1 282 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD33BA6NCL7 494 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM18P0DKX4 95 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 RLN3Q8WXF3 142 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MED6O75586 246 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM64Q6YI46 380 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A14Q7RTX9 510 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MCOLN1Q9GZU1 580 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 EMC7Q9NPA0 242 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf123Q9NWV4 160 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM129A0AVI4 362 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 H7C1C5 153 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MPPED1O15442 326 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF4P23510 183 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MMP11P24347 488 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TEAD1P28347 426 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LCN6P62502 163 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ARG2P78540 354 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf67Q0P5P2 114 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 FGL2Q14314 439 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 BEX5Q5H9J7 111 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CPT1CQ8TCG5 803 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 GCM1Q9NP62 436 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPV4 95 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PAPLNO95428 1278 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ATP1B1P05026 303 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ICAM2P13598 275 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MTCP1P56278 107 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R30P59541 319 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35A2P78381 396 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ZMAT1Q5H9K5 638 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ALKAL2Q6UX46 152 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SIAH3Q8IW03 269 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SLAMF9Q96A28 289 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CTNSO60931 367 aa19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms