RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619245.1

ACACA-244, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 3

Gene ACACA, Length 635 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-244	ENST00000619245	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MANBA	O00462	879 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	OR4F21	O95013	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	PMS2P2	O95744	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	OTC	P00480	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CSF1	P09603	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	UBL4A	P11441	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CCNA2	P20248	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CRABP2	P29373	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SSTR1	P30872	391 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MAP3K8	P41279	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CAPZA2	P47755	286 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MTNR1A	P48039	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	HTR6	P50406	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CDH13	P55290	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SESN3	P58005	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SPIN4	Q56A73	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	LRP11	Q86VZ4	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CDS1	Q92903	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	PDPK1	O15530	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF264	O43296	627 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	KRT6A	P02538	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	KRT6B	P04259	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	BCKDHA	P12694	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	HSD3B1	P14060	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	PAX7	P23759	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	HSD3B2	P26439	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	HMOX2	P30519	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	LCN1	P31025	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	KRT6C	P48668	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MNAT1	P51948	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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