RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TSSK4Q6SA08 328 aa18.68■□□□□ 0.58
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CTDP1-208ENST00000613122 A8MVM7 634 aa18.68■□□□□ 0.58
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CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CTDP1-208ENST00000613122 BOD1Q96IK1 185 aa18.66■□□□□ 0.58
CTDP1-208ENST00000613122 B3GAT1Q9P2W7 334 aa18.66■□□□□ 0.58
CTDP1-208ENST00000613122 LRIT2A6NDA9 550 aa18.66■□□□□ 0.58
CTDP1-208ENST00000613122 SEC14L2O76054 403 aa18.66■□□□□ 0.58
CTDP1-208ENST00000613122 PTTG1O95997 202 aa18.66■□□□□ 0.58
CTDP1-208ENST00000613122 B3GALT4O96024 378 aa18.66■□□□□ 0.58
CTDP1-208ENST00000613122 CD163Q86VB7 1156 aa18.66■□□□□ 0.58
CTDP1-208ENST00000613122 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CTDP1-208ENST00000613122 PHIPQ8WWQ0 1821 aa18.65■□□□□ 0.58
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PPC4 97 aa18.65■□□□□ 0.58
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