RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 LIMS1P48059 325 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 KEAP1Q14145 624 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SYT14P1Q58G82 188 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 DCST1Q5T197 706 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 POMZP3Q6PJE2 187 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 LILRA2Q8N149 483 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 MEIOBQ8N635 442 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM239Q8WW34 195 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL15Q96M94 604 aa21.14■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 NPIPB7O75200 414 aa21.13■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 PEX19P40855 299 aa21.13■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGDIAP52565 204 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PDSS1Q5T2R2 415 aa21.13■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 SLC7A13Q8TCU3 470 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 NRBF2Q96F24 287 aa21.13■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 CRIM1Q9NZV1 1036 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 MED31Q9Y3C7 131 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2T1O43869 369 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 E2F6O75461 281 aa21.12■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF708P17019 499 aa21.12■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 IFNGR2P38484 337 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 MFSD13AQ14CX5 517 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF730Q6ZMV8 503 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR88Q6ZMY6 472 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa21.12■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 LRTOMTQ8WZ04 291 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 DCLRE1BQ9H816 532 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SPRR3Q9UBC9 169 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM5Q9Y2B1 443 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF407Q9C0G0 2248 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A087WUU8 490 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SH3PXD2BA1X283 911 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 ARRDC5A6NEK1 342 aa21.11■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 GGNQ86UU5 652 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM255BQ8WV15 326 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TIMP4Q99727 224 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PRDM14Q9GZV8 571 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAPPC4Q9Y296 219 aa21.11■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 IDUAP35475 653 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 UGT2B15P54855 530 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 CTBP2P56545 445 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 CLDN18P56856 261 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 GXYLT1Q4G148 440 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 WLSQ5T9L3 541 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK20Q8IZL9 346 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SVOPLQ8N434 492 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 OR52J3Q8NH60 311 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-214ENST00000592483 TTYH2Q9BSA4 534 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 TIGARQ9NQ88 270 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PMS2P2O95744 297 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 MT-ATP6P00846 226 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 ACVR2AP27037 513 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SFTPDP35247 375 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKCDQ05655 676 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 MICAQ29983 383 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-214ENST00000592483 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
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