RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 CCL19Q99731 98 aa9.53□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 FOXC2Q99958 501 aa9.53□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 ECSITQ9BQ95 431 aa9.53□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.53□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.53□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 ASB6Q9NWX5 421 aa9.53□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 ARID1AO14497 2285 aa9.53□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 ALPK2Q86TB3 2170 aa9.53□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 USF3Q68DE3 2245 aa9.53□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 GPR171O14626 319 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 DNPH1O43598 174 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 LGI1O95970 557 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 THY1P04216 161 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 PPP3CBP16298 524 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 PCYT1AP49585 367 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 CLDN17P56750 224 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 TUBA1BP68363 451 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 TUBA4AP68366 448 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC25A3Q00325 362 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 P2RY6Q15077 328 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 PDK3Q15120 406 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 VMACQ2NL98 169 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 CARD17Q5XLA6 110 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 TUBA1AQ71U36 451 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 LINGO2Q7L985 606 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 EPHX4Q8IUS5 362 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 WDFY1Q8IWB7 410 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 TSPEARQ8WU66 669 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 NINJ1Q92982 152 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 MOGAT1Q96PD6 335 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 ARHGDIGQ99819 225 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 TRIM2Q9C040 744 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa9.52□□□□□ -0.88
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A0B4J2E0 115 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A1B0GX12 115 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 PRORSD1PA6NEY8 169 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 UPK3AO75631 287 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 HPRP00739 348 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 COX4I1P13073 169 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 HLA-DOBP13765 273 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 COX5AP20674 150 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 OR1E2P47887 323 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 ADAM8P78325 824 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 NRF1Q16656 503 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 ZSWIM7Q19AV6 140 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 NCMAPQ5T1S8 102 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 CREB3L2Q70SY1 520 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 CALHM3Q86XJ0 350 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 STK35Q8TDR2 534 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 HSD17B8Q92506 261 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF583Q96ND8 569 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 SELENONQ9NZV5 590 aa9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 M0R1B8 84 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 KRT33AO76009 404 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 SEC14L2O76054 403 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 CD3EP07766 207 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 FUT4P22083 530 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 RBBP4Q09028 425 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 GABRA6Q16445 453 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 ULK3Q6PHR2 472 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 DEF8Q6ZN54 512 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 LSMEM1Q8N8F7 131 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 MFSD8Q8NHS3 518 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC38A4Q969I6 547 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 EMC6Q9BV81 110 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 CMTM6Q9NX76 183 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC7A7Q9UM01 511 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 ACANP16112 2415 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 VPS13CQ709C8 3753 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.5□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A096LPE4 126 aa9.5□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A1W2PPZ6 126 aa9.5□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 OR5H1A6NKK0 313 aa9.5□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 C11orf98E9PRG8 122 aa9.5□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 SMPD2O60906 423 aa9.5□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 LYPD3O95274 346 aa9.5□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 BGLAPP02818 100 aa9.5□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 NQO1P15559 274 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ANKRD42-209ENST00000533342 MAPRE2Q15555 327 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms