RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496305.5

PHF20-215, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 4

Gene PHF20, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-215	ENST00000496305	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	GFY	I3L273	518 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	AGPAT2	O15120	278 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	MX1	P20591	662 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	NPR2	P20594	1047 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	CMA1	P23946	247 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	GYG1	P46976	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	CDH4	P55283	916 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	NUP107	P57740	925 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	PNKD	Q8N490	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	GBA3	Q9H227	469 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20-215	ENST00000496305	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	TBP	P20226	339 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	GSS	P48637	474 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SEC61G	P60059	68 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	CDK16	Q00536	496 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PSG7	Q13046	419 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NRF1	Q16656	503 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305		Q8N7P7	452 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NPY6R	Q99463	290 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	HSD17B6	O14756	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	CD1C	P29017	333 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	FMO3	P31513	532 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	OPRD1	P41143	372 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	DLX1	P56177	255 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	GNMT	Q14749	295 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	STMN2	Q93045	179 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	GJE1	A6NN92	205 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305		H0Y8G0	127 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ICAM2	P13598	275 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	HSD17B2	P37059	387 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SULT1E1	P49888	294 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ERVK-25	P63136	954 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ITCH	Q96J02	903 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	MBOAT4	Q96T53	435 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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