RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF225	Q9UK10	706 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293		A0A1W2PP18	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	WWP2	O00308	870 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	TP53I11	O14683	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	TPST1	O60507	370 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	SLC25A12	O75746	678 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	OR2J2	O76002	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	DDAH2	O95865	285 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293		P04436	131 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ATP1B1	P05026	303 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	IL3	P08700	152 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	FGF2	P09038	288 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PSG1	P11464	419 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PRPS2	P11908	318 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ETS2	P15036	469 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF23	P17027	643 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	GPX3	P22352	226 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PRPH2	P23942	346 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	NTS	P30990	170 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	CAPG	P40121	348 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	RANBP1	P43487	201 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ASMT	P46597	345 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	CDH15	P55291	814 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PSPH	P78330	225 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	MS4A2	Q01362	244 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PLGLB1	Q02325	96 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	LIPE	Q05469	1076 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	MERTK	Q12866	999 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	TWIST1	Q15672	202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	FHL5	Q5TD97	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	RTL4	Q6ZR62	310 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	NATD1	Q8N6N6	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	NUBPL	Q8TB37	319 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF721	Q8TF20	911 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	RMND5A	Q9H871	391 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75

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