RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.385e-10■■■■□ 24.7
HERC4-211ENST00000492996 FAM53BQ14153 422 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GXYLT1Q4G148 440 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CDK20Q8IZL9 346 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 UFD1Q92890 307 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RFKQ969G6 155 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RELTQ969Z4 430 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MIB2Q96AX9 1013 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ABCB9Q9NP78 766 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MALT1Q9UDY8 824 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CBLCQ9ULV8 474 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 A0A087WV62 115 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GWA3 101 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CD8B2A6NJW9 211 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KLF4O43474 513 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FOXS1O43638 330 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR2B3O76000 313 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NCR1O76036 304 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 THBS1P07996 1170 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SLC35E2P0CK97 266 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CD8BP10966 210 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CPEP16870 476 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF3P17036 446 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ARHGDIBP52566 201 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CCDC190Q86UF4 302 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NR4A3Q92570 626 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KCTD7Q96MP8 289 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LMF1Q96S06 567 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GPR87Q9BY21 358 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MED31Q9Y3C7 131 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CASKO14936 926 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 AKR7A2O43488 359 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R3DO95685 299 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HMGN1P05114 100 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MYF5P13349 255 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FOXK1P85037 733 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 AMZ1Q400G9 498 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MRGPREQ86SM8 312 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TMEM99Q8N816 258 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ASB15Q8WXK1 588 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PPA2Q9H2U2 334 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GVT2 93 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TMEM129A0AVI4 362 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HMX3A6NHT5 357 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 S1PR1P21453 382 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GABRA4P48169 554 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CCR4P51679 360 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PUDPQ08623 228 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DSG2Q14126 1118 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
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