RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	GRPR	P30550	384 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP6V1E1	P36543	226 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	LIPA	P38571	399 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ETV1	P50549	477 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC16A1	P53985	500 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TMED1	Q13445	227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SGCB	Q16585	318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	BEST3	Q8N1M1	668 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5J2	Q8NH18	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR6S1	Q8NH40	331 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	POC1B	Q8TC44	478 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	RELT	Q969Z4	430 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	DDIT4L	Q96D03	193 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SGCZ	Q96LD1	299 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	IP6K3	Q96PC2	410 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ASPN	Q9BXN1	380 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1W2PPW3	197 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM129	A0AVI4	362 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	PROB1	E7EW31	1015 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435		G3V3Y1	287 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	IMPA2	O14732	288 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2T1	O43869	369 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHA1	P01876	353 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435		P04436	131 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	F13B	P05160	661 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	CLU	P10909	449 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SDHA	P31040	664 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	IDUA	P35475	653 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SELENBP1	Q13228	472 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	AQP6	Q13520	282 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	DOC2B	Q14184	412 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC6A19	Q695T7	634 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	LEG1	Q6P5S2	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM122B	Q7Z309	247 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	DTX1	Q86Y01	620 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	PTP4A1	Q93096	173 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	NTNG2	Q96CW9	530 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435		Q96M85	177 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OPALIN	Q96PE5	141 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	NMNAT3	Q96T66	252 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	MGLL	Q99685	303 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	PROK2	Q9HC23	129 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	DKKL1	Q9UK85	242 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A087WZY1	265 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIM64B	A6NI03	449 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	C11orf98	E9PRG8	122 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435		H3BML4	177 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF13	O43567	381 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SNX4	O95219	450 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR6A2	O95222	327 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TXNDC12	O95881	172 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	GYPB	P06028	91 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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