RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 COQ3Q9NZJ6 369 aa17.09■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 KCNMB2Q9Y691 235 aa17.09■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 PRAF2O60831 178 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 TGM6O95932 706 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 ATXN8OSP0DMR3 200 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 NID1P14543 1247 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 AVPR2P30518 371 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 MADCAM1Q13477 382 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 GSG1Q2KHT4 349 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 GDF7Q7Z4P5 450 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 TPRA1Q86W33 373 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 NKAIN4Q8IVV8 208 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 OR56B4Q8NH76 319 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 PMM1Q92871 262 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC74AQ96AQ1 378 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 SLC41A2Q96JW4 573 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 SDHAF2Q9NX18 166 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 NLGN3Q9NZ94 848 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 ATPIF1Q9UII2 106 aa17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
SPNS1-204ENST00000352260 SDK1Q7Z5N4 2213 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 SOX30O94993 753 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 IGHA1P01876 353 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 FOLR1P15328 257 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 CXCL3P19876 107 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 GCGRP47871 477 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 PITPNAQ00169 270 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 SLC22A10Q63ZE4 541 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 ACSM5Q6NUN0 579 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 SLC27A4Q6P1M0 643 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM91Q6ZNR0 172 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 ASB18Q6ZVZ8 466 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 RRM2BQ7LG56 351 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 PM20D2Q8IYS1 436 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 IQCF1Q8N6M8 205 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 LANCL2Q9NS86 450 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 PILRBQ9UKJ0 227 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 ERVK-19Q9WJR5 959 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 DTX4Q9Y2E6 619 aa17.08■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 VPS13AQ96RL7 3174 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 TRAV6A0A075B6T7 132 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 PRAMEF2O60811 474 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 H2AFB2P0C5Z0 115 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 IFNGR2P38484 337 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 OR1D4P47884 311 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 TRAM1Q15629 374 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 DECR1Q16698 335 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 NPSR1Q6W5P4 371 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 OR52H1Q8NGJ2 320 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 TEX47Q8TBZ9 253 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 NUDT22Q9BRQ3 303 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 FSCN3Q9NQT6 498 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 MED17Q9NVC6 651 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 MYO15AQ9UKN7 3530 aa17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1B0GTQ1 180 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 SHISA3A0PJX4 238 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 CDHR4A6H8M9 788 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 OR6C65A6NJZ3 312 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 A8MUA0 341 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 A8MXK9 166 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 LANCL1O43813 399 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 NCR1O76036 304 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 IGKV1D-16P01601 117 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 PRG2P13727 222 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 PGDP52209 483 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 FUT7Q11130 342 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 DYRK1AQ13627 763 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 SERTAD2Q14140 314 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 SLC36A2Q495M3 483 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00518Q8N0U6 118 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 TOMM5Q8N4H5 51 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 OR4N2Q8NGD1 307 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 PIGXQ8TBF5 258 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 MVB12AQ96EY5 273 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 TMED9Q9BVK6 235 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 IFT46Q9NQC8 304 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF175Q9Y473 711 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 GUSBP08236 651 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 GKN3PP0CG01 181 aa17.06■□□□□ 0.32
SPNS1-204ENST00000352260 HTR2AP28223 471 aa17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms