RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 RCBTB2O95199 551 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTL6AO96019 429 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 H1F0P07305 194 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP12AP54707 1039 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 PDK3Q15120 406 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 DECR1Q16698 335 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 FIGNL1Q6PIW4 674 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 USP51Q70EK9 711 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 LUZP2Q86TE4 346 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 COMTD1Q86VU5 262 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 NODALQ96S42 347 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 FUZQ9BT04 418 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SFXN3Q9BWM7 321 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SMURF2Q9HAU4 748 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCF1Q9UBD9 225 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNE5Q9UJ90 142 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10H1Q9Y4A9 318 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CDHR4A6H8M9 788 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SNPHO15079 494 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 IL33O95760 270 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKACGP22612 351 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TMED10P49755 219 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH12P55289 794 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK14Q16539 360 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 HS3ST5Q8IZT8 346 aa21.65■■□□□ 1.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO34Q9NWN3 711 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf72A6NCS6 295 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 J3KTA2 159 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A6O15403 523 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 PPM1BO75688 479 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV1D-16P01601 117 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP4B1P13584 511 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 MYF6P23409 242 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 DAPP51397 102 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TOMM20Q15388 145 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 NPTX1Q15818 432 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 Q5PR19 223 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF836Q6ZNA1 936 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 OFCC1Q8IZS5 231 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 WDSUB1Q8N9V3 476 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4N2Q8NGD1 307 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1J4Q8NGS1 313 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 WFDC6Q9BQY6 131 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2B2Q9GZK3 357 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TMCC3Q9ULS5 477 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-216ENST00000628306 COL6A5A8TX70 2615 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 A8MXE2 369 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB108AA8MXU0 73 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 M0R3H8 397 aa21.63■■□□□ 1.05
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CAPNS1-216ENST00000628306 TNFSF13O75888 250 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNB2O95067 398 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 SNAP29O95721 258 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 YAP1P46937 504 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
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CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 IL18R1Q13478 541 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 DEF8Q6ZN54 512 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10G2Q8NGC3 310 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP3Q96NJ6 502 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 FNDC11Q9BVV2 318 aa21.63■■□□□ 1.05
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CAPNS1-216ENST00000628306 ENOPH1Q9UHY7 261 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 B4DXG7 233 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 AP3D1O14617 1153 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5F1O95221 314 aa21.62■■□□□ 1.05
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CAPNS1-216ENST00000628306 NRG3P56975 720 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT2A3Q6UWM9 527 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 GCNT2Q8N0V5 402 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT2BQ93097 391 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 TOR3AQ9H497 397 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 UBQLN4Q9NRR5 601 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ATRQ13535 2644 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 HIVEP2P31629 2446 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 E9PQ18 207 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 H7C1Q1 480 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT2B11O75310 529 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 NGFRP08138 427 aa21.61■■□□□ 1.05
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