RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 ABCA4P78363 2273 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ELOVL7A1L3X0 281 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 LIPT2A6NK58 231 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 GPR171O14626 319 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 DNPH1O43598 174 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 RAMP1O60894 148 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF682O95780 498 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 IGHV3-9P01782 118 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 EPXP11678 715 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 IMPDH2P12268 514 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 IL32P24001 234 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 GZMMP51124 257 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 DUSP7Q16829 419 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM225Q6GV28 225 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 TFAP2EQ6VUC0 442 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 DEF8Q6ZN54 512 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 CALHM3Q86XJ0 350 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM99Q8N816 258 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 GPR32P1Q8NGA4 272 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC38A4Q969I6 547 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 APH1AQ96BI3 265 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC47A1Q96FL8 570 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 LRRC37BQ96QE4 947 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 POTEKPQ9BYX7 375 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 BCO1Q9HAY6 547 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 GP6Q9HCN6 339 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 CMTM6Q9NX76 183 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ADA2Q9NZK5 511 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 BAG5Q9UL15 447 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.19□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 SPG11Q96JI7 2443 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 A6NNC1 897 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF724A8MTY0 619 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM229AB2RXF0 380 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF814B7Z6K7 855 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 GMNNO75496 209 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 LGI1O95970 557 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ADAP00813 363 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 C8BP07358 591 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 NQO1P15559 274 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 TNFRSF1BP20333 461 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 CBLP22681 906 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 PRDX6P30041 224 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP10-9P60411 292 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 PSME3P61289 254 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 VEZF1Q14119 521 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 TSC22D1Q15714 1073 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 NRF1Q16656 503 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ENTPD8Q5MY95 495 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 PAQR6Q6TCH4 344 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 CARM1Q86X55 608 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 WFDC8Q8IUA0 241 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC15A3Q8IY34 581 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 LSMEM1Q8N8F7 131 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 OR6T1Q8NGN1 323 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 STK35Q8TDR2 534 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 LZICQ8WZA0 190 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM162AQ96A26 154 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 CCT8L2Q96SF2 557 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 EPYCQ99645 322 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ARHGDIGQ99819 225 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 WFDC6Q9BQY6 131 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ACTR6Q9GZN1 396 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 EVA1AQ9H8M9 152 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF226Q9NYT6 803 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 PRSS50Q9UI38 385 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 TESMINQ9Y4I5 508 aa10.18□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0B4J2E0 115 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1B0GX12 115 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 AQP7P3A6NL99 342 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF716A6NP11 495 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 CXCR6O00574 342 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 NME4O00746 187 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 NDUFAB1O14561 156 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 TPST2O60704 377 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 LYZL6O75951 148 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 KRT33AO76009 404 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 CCKARP32238 428 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 OR1E2P47887 323 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 OR3A2P47893 321 aa10.17□□□□□ -0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 GSK3BP49841 420 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms