RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1B0GVX0 72 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PNN7 141 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC7A4O43246 635 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUX1O43812 170 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 F10P00742 488 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF30P17039 623 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 BDNFP23560 247 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 BTCP35070 178 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 ESRRGP62508 458 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRKCDQ05655 676 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDC20Q12834 499 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 RIPK1Q13546 671 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCARB2Q14108 478 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDIA5Q14554 519 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 GUCA2BQ16661 112 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 PARP10Q53GL7 1025 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYT10Q6XYQ8 523 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD37Q7Z713 158 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR86Q86TI4 376 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM69Q86WT6 500 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGF11Q92914 225 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC58Q96CX6 371 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 STACQ99469 402 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEFB127Q9H1M4 99 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOLH1BQ9HBA9 442 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 COMMD8Q9NX08 183 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 QPCTLQ9NXS2 382 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLCF1Q9UBD9 225 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANAPC7Q9UJX3 599 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 NFASCO94856 1347 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 BAHCC1Q9P281 2608 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM223A0PJW6 202 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 LGALS8O00214 317 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAD51BO15315 384 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 STX7O15400 261 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC31A2O15432 143 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 OLFM2O95897 454 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 RALAP11233 206 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRPS2P11908 318 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP2B6P20813 491 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFSF9P41273 254 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASPHQ12797 758 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX1Q13596 522 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYTH1Q15438 398 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC5A12Q1EHB4 618 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 C12orf60Q5U649 245 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 BIVMQ86UB2 503 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR1N2Q8NGR9 330 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF5Q99942 180 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 LZTS2Q9BRK4 669 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM246Q9BRR3 403 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADPGKQ9BRR6 497 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMYD3Q9H7B4 428 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPACA6W5XKT8 324 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 LGALS9O00182 355 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRDX6P30041 224 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SGCAQ16586 387 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM16LQ309B1 348 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCN12Q6JVE5 192 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 HCP5Q6MZN7 132 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 CBLN3Q6UW01 205 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 TPRA1Q86W33 373 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC26A11Q86WA9 606 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM17Q86X19 198 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF664Q8N3J9 261 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SFRP1Q8N474 314 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR2G3Q8NGZ4 309 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 EEF2KMTQ96G04 330 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBCDQ9BTW9 1192 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTPS2Q9NRF8 586 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 RDH8Q9NYR8 311 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF6Q9Y252 685 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF222A6NCQ9 220 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 C12orf71A8MTZ7 269 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCTN6O00399 190 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 XKRYO14609 159 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 BGLAPP02818 100 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSPA1LP34931 641 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFC4P35249 363 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms