RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482072.1

ABCA9-205, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 9, human

TSL 3

Gene ABCA9, Length 235 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA9-205	ENST00000482072		V9GY05	133 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072		A0A075B6Q4	140 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072		A0A1W2PPE3	182 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TOM1	O60784	492 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	IFNA8	P32881	189 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	OR3A4P	P47883	348 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	PRMT2	P55345	433 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	BID	P55957	195 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	GRB7	Q14451	532 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	DGUOK	Q16854	277 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	MRAP	Q8TCY5	172 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TBX15	Q96SF7	602 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	EBF4	Q9BQW3	602 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	RNF126	Q9BV68	326 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	MFF	Q9GZY8	342 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	CD274	Q9NZQ7	290 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	NSD2	O96028	1365 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TNR	Q92752	1358 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	FAM168B	A1KXE4	195 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	SMCO3	A2RU48	225 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	HCRTR1	O43613	425 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	UPK3A	O75631	287 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	IGHV3-23	P01764	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	MMP1	P03956	469 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	CRYGB	P07316	175 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TBP	P20226	339 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	CHML	P26374	656 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	KIR2DS4	P43632	304 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	HLCS	P50747	726 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF45	Q02386	682 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	ARFRP1	Q13795	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	KYAT1	Q16773	422 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	ISX	Q2M1V0	245 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	CARD16	Q5EG05	197 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	RAET1L	Q5VY80	246 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF677	Q86XU0	584 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	MAGEB18	Q96M61	343 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	FMO2	Q99518	471 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	CENPK	Q9BS16	269 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	MARCH5	Q9NX47	278 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072		C9JVG2	144 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072		K7N7A8	449 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	HSD17B6	O14756	317 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	PSTPIP1	O43586	416 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	SOX15	O60248	233 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	BBOX1	O75936	387 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	ERLIN2	O94905	339 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	STAMBP	O95630	424 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TMEM50A	O95807	157 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	SFTPC	P11686	197 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	GABRR1	P24046	479 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	AQP1	P29972	269 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	GLP1R	P43220	463 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	PRRX1	P54821	245 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	DIO3	P55073	304 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ABCA9-205	ENST00000482072	RIPPLY3	P57055	190 aa		3.35	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms