RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 FJX1Q86VR8 437 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 FAM131BQ86XD5 332 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 GPR65Q8IYL9 337 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 DEFB106AQ8N104 65 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 LNX2Q8N448 690 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 AVL9Q8NBF6 648 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.61□□□□□ -1.35
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PKP4-211ENST00000481115 PIGXQ8TBF5 258 aa6.61□□□□□ -1.35
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PKP4-211ENST00000481115 CCDC107Q8WV48 283 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.61□□□□□ -1.35
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PKP4-211ENST00000481115 SLAMF9Q96A28 289 aa6.61□□□□□ -1.35
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PKP4-211ENST00000481115 NOX3Q9HBY0 568 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.61□□□□□ -1.35
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PKP4-211ENST00000481115 TBX21Q9UL17 535 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 GPR34Q9UPC5 381 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.61□□□□□ -1.35
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PKP4-211ENST00000481115 F8VWA3 439 aa6.6□□□□□ -1.35
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PKP4-211ENST00000481115 EPCAMP16422 314 aa6.6□□□□□ -1.35
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PKP4-211ENST00000481115 GAB1Q13480 694 aa6.6□□□□□ -1.35
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PKP4-211ENST00000481115 SYT14P1Q58G82 188 aa6.6□□□□□ -1.35
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PKP4-211ENST00000481115 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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