RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 GM2AP17900 193 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 POU4F3Q15319 338 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 NUDT8Q8WV74 236 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GLIPR2Q9H4G4 154 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM202A6NGA9 273 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 IFNA17P01571 189 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 BIDP55957 195 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 FAM69AQ5T7M9 428 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF585AQ6P3V2 769 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PFDN5Q99471 154 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ALG12Q9BV10 488 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MS4A8Q9BY19 250 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MCOLN1Q9GZU1 580 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MT-CO2P00403 227 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ALPLP05186 524 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MTCP1P56278 107 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 SEMA3BQ13214 749 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GPR19Q15760 415 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GATA6Q92908 595 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ZFP57Q9NU63 452 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 H0Y8X5 98 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GFRA2O00451 464 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 REEP5Q00765 189 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 OR52W1Q6IF63 320 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MARCH3Q86UD3 253 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PAQR8Q8TEZ7 354 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF583Q96ND8 569 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CCL11P51671 97 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ATG4BQ9Y4P1 393 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ANKRD12Q6UB98 2062 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 C7orf72A4D263 438 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 IFNA10P01566 189 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 BDH1Q02338 343 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 HNF4GQ14541 408 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 IL37Q9NZH6 218 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 C5P01031 1676 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GON4LQ3T8J9 2241 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CACNG3O60359 315 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM185AQ8NFB2 350 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ARL11Q969Q4 196 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 HDAC8Q9BY41 377 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TMED7Q9Y3B3 224 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 CD63P08962 238 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MEF2DQ14814 521 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 BCL7AQ4VC05 210 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 NOXA1Q86UR1 476 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 STEAP2Q8NFT2 490 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RPS10P5Q9NQ39 176 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TP53P04637 393 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ESX1Q8N693 406 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ASB17Q8WXJ9 295 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 METTL9Q9H1A3 318 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MEIOCA2RUB1 952 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 DPP4P27487 766 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 VN1R2Q8NFZ6 395 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 OR7G2Q8NG99 324 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 AMDHD1Q96NU7 426 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TSPAN11A1L157 253 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 IKZF1Q13422 519 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 FAM26DQ5JW98 314 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MRI1Q9BV20 369 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 GLB1L2Q8IW92 636 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MIB2Q96AX9 1013 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 MICU1Q9BPX6 476 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 RAB9BQ9NP90 201 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 SURF4O15260 269 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-209ENST00000438120 PFN3P60673 137 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms