RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM169BQ8N8A8 192 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 NUP37Q8NFH4 326 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 OR8J2Q8NGG1 315 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 OR4A15Q8NGL6 344 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ZFAND2BQ8WV99 257 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 TUBGCP3Q96CW5 907 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 SNX18Q96RF0 628 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF442Q9H7R0 627 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 METRNQ9UJH8 293 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 LIPT2A6NK58 231 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 AQP7P3A6NL99 342 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 SMIM23A6NLE4 172 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 VSTM5A8MXK1 200 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT33AO76009 404 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 AKR7A3O95154 331 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 VENTXO95231 258 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 GPIP06744 558 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 CECR9P0C854 216 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 UQCRC2P22695 453 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 CALCRP30988 508 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ARRB2P32121 409 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 RIN1Q13671 783 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 CEACAM7Q14002 265 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 SAXO2Q658L1 398 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 MECRQ9BV79 373 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ASIC5Q9NY37 505 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM129A0AVI4 362 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 AGAP5A6NIR3 686 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF587BE7ETH6 402 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 hCG_2039718K7EN88 272 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 NR5A2O00482 541 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 IGKV3-15P01624 115 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 PCMT1P22061 227 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 SERPINB5P36952 375 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 KHKP50053 298 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 P2RY4P51582 365 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 LGALS3BPQ08380 585 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 OR7A5Q15622 319 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 GSTA3Q16772 222 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 GPAT3Q53EU6 434 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM225Q6GV28 225 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 DEF8Q6ZN54 512 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 LINGO2Q7L985 606 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 GPAT4Q86UL3 456 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 UBASH3BQ8TF42 649 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 WDR60Q8WVS4 1066 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 NEURL3Q96EH8 262 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 OCEL1Q9H607 264 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 SEC61A2Q9H9S3 476 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 MKS1Q9NXB0 559 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 CFAP73A6NFT4 308 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 OR6C65A6NJZ3 312 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 VAMP5O95183 116 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 IFNGR1P15260 489 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 EGR1P18146 543 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 NPR2P20594 1047 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 THBS4P35443 961 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 COMPP49747 757 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 SELENOPP49908 381 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 TUBA1BP68363 451 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 TUBA4AP68366 448 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 HPCAP84074 193 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 EPS8Q12929 822 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIP10Q15642 601 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 SMU1Q2TAY7 513 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 RINLQ6ZS11 566 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 CREB3L2Q70SY1 520 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 TUBA1AQ71U36 451 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKRD46Q86W74 232 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 SVOPLQ8N434 492 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 APOPT1Q96IL0 206 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKRD27Q96NW4 1050 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC38A1Q9H2H9 487 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 NELFAQ9H3P2 528 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 PRDM4Q9UKN5 801 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A096LPE4 126 aa12.9□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A1W2PPZ6 126 aa12.9□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 B4DSR2 109 aa12.9□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 HMGN4O00479 90 aa12.9□□□□□ -0.34
ACTBP11-201ENST00000436287 UPK3AO75631 287 aa12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms