RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC17Q8N6Y2 441 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 EXD3Q8N9H8 876 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCAIQ8N9R8 606 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX19Q8NA77 164 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR13C2Q8NGS9 318 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5J2Q8NH18 312 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 FANK1Q8TC84 345 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMPDL3BQ92485 455 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 OSTF1Q92882 214 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBOAT4Q96T53 435 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADI1Q9BV57 179 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDEL1Q9GZM8 345 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIBC2Q9H4K1 309 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 EXO5Q9H790 373 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALKBH4Q9NXW9 302 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB26Q9ULW5 256 aa15.24■□□□□ 0.03
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DNPH1O43598 174 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 OPN1LWP04000 364 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TP53P04637 393 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPAN19P0C672 248 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 IMPDH2P12268 514 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHC1P29353 583 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 DIO1P49895 249 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC35A1P78382 337 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR7A5Q15622 319 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 SGCBQ16585 318 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC23Q5W5X9 447 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 VASNQ6EMK4 673 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 GGNQ86UU5 652 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF18BQ86Y91 864 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR51A7Q8NH64 312 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX47Q8TBZ9 253 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR52D1Q9H346 318 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 LIPGQ9Y5X9 500 aa15.23■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV27A0A087WT01 109 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0J9YW62 118 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PNR3 127 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC16A6O15403 523 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFB2O95178 105 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOX14O95416 240 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF708P17019 499 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRPRP30550 384 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPGP40121 348 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 STARP49675 285 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLDN20P56880 219 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2B6P58173 313 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAC3P60763 192 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLRB1Q12918 225 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 PMS2P3Q13401 168 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 FHL1Q13642 323 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 HBMQ6B0K9 141 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEIOBQ8N635 442 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q8NA96 180 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2V1Q8NHB1 315 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYGBQ8WWM9 190 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TFAP2CQ92754 450 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 WBP1Q96G27 269 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRG7Q96K78 797 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q9H521 79 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 EGLN3Q9H6Z9 239 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 MCCC2Q9HCC0 563 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIGARQ9NQ88 270 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa15.22■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGF2RP11717 2491 aa15.21■□□□□ 0.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPIPA5E9PKD4 350 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 E9PQ18 207 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0R082 166 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 AQP7O14520 342 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFSF11O14788 317 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEC14L5O43304 696 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 CPN1P15169 458 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 POU1F1P28069 291 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC6A6P31641 620 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 UQCRC1P31930 480 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS6KA3P51812 740 aa15.21■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLDN18P56856 261 aa15.21■□□□□ 0.02
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