RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 TFPIP10646 304 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 SGCBQ16585 318 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 OCLNQ16625 522 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 LAIR2Q6ISS4 152 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 THSD4Q6ZMP0 1018 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 SCAIQ8N9R8 606 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 OR5J2Q8NH18 312 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM163Q8TC26 289 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 UBE2FQ969M7 185 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 OR11A1Q9GZK7 315 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 GJE1A6NN92 205 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 RRP8O43159 456 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 IDH3BO43837 385 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 IFNGP01579 166 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 PEPDP12955 493 aa22.17■■□□□ 1.14
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ECHDC3-201ENST00000379215 FMO3P31513 532 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 UQCRC1P31930 480 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 RPL4P36578 427 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 TUBA4AP68366 448 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 EFNB1P98172 346 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 LTBQ06643 244 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 FOXO1Q12778 655 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 BLMHQ13867 455 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC103Q8IW40 242 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 TM9SF4Q92544 642 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 IL4I1Q96RQ9 567 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 NPAS1Q99742 590 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 OR2B2Q9GZK3 357 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 FN3KQ9H479 309 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 IL20RAQ9UHF4 553 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 LINC01387J3KSC0 135 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 PRKYO43930 277 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 ZIC3O60481 467 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM20BO75063 409 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 WISP1O95388 367 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 NOS3P29474 1203 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 TOMM20Q15388 145 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 ALG10Q5BKT4 473 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 SULF2Q8IWU5 870 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 SCMH1Q96GD3 660 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 ALKBH4Q9NXW9 302 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 RIIAD1A6NNX1 92 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 SHISA8B8ZZ34 492 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 ARPC3O15145 178 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 FZD7O75084 574 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
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ECHDC3-201ENST00000379215 ID4P47928 161 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 FOXK2Q01167 660 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 C1QL3Q5VWW1 255 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC6A19Q695T7 634 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 OR14L1PQ8NHC6 308 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC25A36Q96CQ1 311 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 CMC2Q9NRP2 79 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 FTCDNL1E5RQL4 147 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 H3BML4 177 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 OR6A2O95222 327 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF3P17036 446 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 GRPRP30550 384 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 TNFSF10P50591 281 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 APOFQ13790 326 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF766Q5HY98 468 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 SPACA3Q8IXA5 215 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 LRR1Q96L50 414 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 NRIP3Q9NQ35 241 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 QPCTLQ9NXS2 382 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 KLHL21Q9UJP4 597 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3-201ENST00000379215 OR2M5A3KFT3 312 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 M0R129 80 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 IMPA2O14732 288 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 EFNA2O43921 213 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PPP1R3DO95685 299 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 CD14P08571 375 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 AQP2P41181 271 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 RAC1P63000 192 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PMS2P3Q13401 168 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 HYAL4Q2M3T9 481 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF540Q8NDQ6 660 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 RFKQ969G6 155 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM122AQ96E09 287 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ENKD1Q9H0I2 346 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 BATF3Q9NR55 127 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 KLHL1Q9NR64 748 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 TRAPPC4Q9Y296 219 aa22.13■■□□□ 1.13
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