RNA–Protein interactions for RNA: YGR006W

PRP18, Transcript of Splicing factor and component of snRNP U5, yeast

Gene PRP18, Length 756 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP18	YGR006W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	UPC2	Q12151	913 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	ELM1	P32801	640 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	HSL7	P38274	827 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	YHR078W	P38799	552 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	UBP12	P39538	1254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	MGS1	P40151	587 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	IRC24	P40580	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	NCS6	P53088	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	GUP2	Q08929	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	NUP145	P49687	1317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	TSR4	P25040	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	CRR1	Q05790	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	ATG33	Q06485	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	THI73	Q07904	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP18	YGR006W	STE14	P32584	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	YFL052W	P43551	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	ZIP2	P53061	704 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	MET13	P53128	600 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	NPY1	P53164	384 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	GUD1	Q07729	489 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
PRP18	YGR006W	GRX4	P32642	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	TOD6	P34219	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	PLB1	P39105	664 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	PZF1	P39933	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	SSY5	P47002	699 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	YGR237C	P50089	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	UME1	Q03010	460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	SWM1	Q12379	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	NPC2	Q12408	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	YLR358C	O13565	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	HMG1	P12683	1054 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	BNA2	P47125	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	AIM14	P53109	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	STE11	P23561	717 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	MIH1	P23748	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	NGG1	P32494	702 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	YEN1	P40028	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	HFD1	Q04458	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
PRP18	YGR006W	FLR1	P38124	548 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	CKB2	P38930	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	SAK1	P38990	1142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	ASI2	P53895	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	LST4	P34239	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	THI80	P35202	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	YKR018C	P36114	725 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	YKR051W	P36142	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	VHR1	P40522	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	YJR096W	P47137	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	PKH1	Q03407	766 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	PEX19	Q07418	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	ENB1	Q08299	606 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP18	YGR006W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	EXG2	P52911	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	TMA10	Q06177	86 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	KAR4	P25583	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	MSS4	P38994	779 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	UBP5	P39944	805 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	PFA3	P42836	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	PCL10	P53124	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	GPG1	P53130	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	YBP2	P53169	641 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	ORC4	P54791	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	TRM11	Q12463	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	MAL31	P38156	614 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	RET2	P43621	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	YLR415C	O13578	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	YBR259W	P38338	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	PAF1	P38351	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	TDA3	P38758	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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