RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ELF2Q15723 593 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 DDX11Q96FC9 970 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 USP16Q9Y5T5 823 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 A0A0D9SFI3 127 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 KRT222Q8N1A0 295 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 EVI5LQ96CN4 794 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 TMEM51Q9NW97 253 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 SKILP12757 684 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 RPS6KB1P23443 525 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 CCZ1BP86790 482 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 PTPN14Q15678 1187 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 TAF3Q5VWG9 929 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 NWD1Q149M9 1564 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 RESTQ13127 1097 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 SARM1Q6SZW1 724 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 FAM53CQ9NYF3 392 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 AACSQ86V21 672 aa24.14■■□□□ 1.46
PMS1-222ENST00000639501 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 CCDC69A6NI79 296 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 PSMA5P28066 241 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 ZNF446Q9NWS9 450 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 BRF1Q92994 677 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 NPHP1O15259 732 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 MTX1Q13505 466 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 GPATCH3Q96I76 525 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 KCNQ3O43525 872 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 LRRN4CLQ8ND94 238 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 ERO1AQ96HE7 468 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD1Q15327 319 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 MED23Q9ULK4 1368 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 ERICH4A6NGS2 130 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 SNRKQ9NRH2 765 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 GTF3C6Q969F1 213 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 PIK3C2AO00443 1686 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-222ENST00000639501 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 SASH1O94885 1247 aa24.08■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 FOSBP53539 338 aa24.08■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 STX1AQ16623 288 aa24.08■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.08■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 NEMFO60524 1076 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 FBXW7Q969H0 707 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 FSD1Q9BTV5 496 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 SLU7O95391 586 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 CAVIN2O95810 425 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 HOXC9P31274 260 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 COL15A1P39059 1388 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 RNF20Q5VTR2 975 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 NBPF11Q86T75 865 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 LGR6Q9HBX8 967 aa24.05■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 BECN2A8MW95 431 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 H3BQV1 296 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 IFFO2Q5TF58 517 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 JCADQ9P266 1359 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa24.04■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 HIP1O00291 1037 aa24.03■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 CHGBP05060 677 aa24.03■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.03■■□□□ 1.44
PMS1-222ENST00000639501 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.03■■□□□ 1.44
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