RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD1Q15327 319 aa22.19■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.19■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 KRT32Q14532 448 aa22.18■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.18■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 ARXQ96QS3 562 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 ITGB4P16144 1822 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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CLN8-211ENST00000636934 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 ZNF445P59923 1031 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.16■■□□□ 1.14
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CLN8-211ENST00000636934 PALLDQ8WX93 1383 aa22.15■■□□□ 1.14
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CLN8-211ENST00000636934 TAF5LO75529 589 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 FBXO41Q8TF61 875 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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CLN8-211ENST00000636934 ZNF609O15014 1411 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 SPEF2Q9C093 1822 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.13■■□□□ 1.13
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CLN8-211ENST00000636934 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 CPA1P15085 419 aa22.12■■□□□ 1.13
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CLN8-211ENST00000636934 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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CLN8-211ENST00000636934 STX6O43752 255 aa22.12■■□□□ 1.13
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CLN8-211ENST00000636934 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.12■■□□□ 1.13
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CLN8-211ENST00000636934 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 GPT2Q8TD30 523 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 LRRC24Q50LG9 513 aa22.1■■□□□ 1.13
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CLN8-211ENST00000636934 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.1■■□□□ 1.13
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CLN8-211ENST00000636934 CSF1RP07333 972 aa22.1■■□□□ 1.13
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CLN8-211ENST00000636934 SYT1P21579 422 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 PANK2Q9BZ23 570 aa22.09■■□□□ 1.13
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CLN8-211ENST00000636934 TIMM10P62072 90 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN8-211ENST00000636934 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.08■■□□□ 1.13
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CLN8-211ENST00000636934 PDCP20941 246 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN8-211ENST00000636934 ME3Q16798 604 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN8-211ENST00000636934 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CLN8-211ENST00000636934 F13A1P00488 732 aa22.06■■□□□ 1.12
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CLN8-211ENST00000636934 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CLN8-211ENST00000636934 GORABQ5T7V8 394 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-211ENST00000636934 NLRP10Q86W26 655 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-211ENST00000636934 FAM89AQ96GI7 184 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-211ENST00000636934 NEK1Q96PY6 1258 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-211ENST00000636934 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-211ENST00000636934 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.06■■□□□ 1.12
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