RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SUSD4Q5VX71 490 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF541Q9H0D2 1346 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FZD9O00144 591 aa11.27□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NIM1KQ8IY84 436 aa11.27□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.27□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.27□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CLCN6P51797 869 aa11.26□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NEUROD2Q15784 382 aa11.26□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CNTROBQ8N137 903 aa11.26□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.26□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ABCC12Q96J65 1359 aa11.26□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PPIP5K2O43314 1243 aa11.25□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GABBR2O75899 941 aa11.25□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NTSR2O95665 410 aa11.25□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NECTIN2Q92692 538 aa11.25□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.25□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BBOX1O75936 387 aa11.24□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GOLGA2Q08379 1002 aa11.24□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.24□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COPS6Q7L5N1 327 aa11.24□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.24□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 VPS33BQ9H267 617 aa11.24□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PASKQ96RG2 1323 aa11.24□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CNTNAP1P78357 1384 aa11.24□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CACNA1SQ13698 1873 aa11.23□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANXA1P04083 346 aa11.23□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TIE1P35590 1138 aa11.23□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.23□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.23□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa11.23□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.23□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.23□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SCN4AP35499 1836 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 VEGFBP49765 207 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TCIRG1Q13488 830 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PDIA6Q15084 440 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MPNDQ8N594 471 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RUNDC1Q96C34 613 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BCL2L13Q9BXK5 485 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.22□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EPS15P42566 896 aa11.21□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ECE1P42892 770 aa11.21□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TNIP1Q15025 636 aa11.21□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AOC3Q16853 763 aa11.21□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PROSER3Q2NL68 480 aa11.21□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa11.21□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMC4Q7Z404 712 aa11.21□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NLRP10Q86W26 655 aa11.21□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SP8Q8IXZ3 490 aa11.21□□□□□ -0.61
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ABCC4O15439 1325 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHL1O00533 1208 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FOXN1O15353 648 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GRM1Q13255 1194 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PRDM10Q9NQV6 1147 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RASSF10A6NK89 507 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SCNN1DP51172 638 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GRAPQ13588 217 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHPF2Q9P2E5 772 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms