RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590499.1

SMAD4-211, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-211ENST00000590499 CFAP44Q96MT7 982 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 PDIA6Q15084 440 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 KRT24Q2M2I5 525 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.63□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 MBIPQ9NS73 344 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.62□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 MFSD10Q14728 455 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 CCDC27Q2M243 656 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 IFT57Q9NWB7 429 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 HOXB7P09629 217 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 CHRNA5P30532 468 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 HLFQ16534 295 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 PROSER3Q2NL68 480 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 SETDB2Q96T68 719 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 ATP10DQ9P241 1426 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 MYL6BP14649 208 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 GNAI1P63096 354 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 WWC1Q8IX03 1113 aa14.58□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 NGEFQ8N5V2 710 aa14.58□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 PIM2Q9P1W9 311 aa14.58□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.57□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 ANXA1P04083 346 aa14.57□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 CNBD1Q8NA66 436 aa14.57□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.57□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.57□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 BCS1LQ9Y276 419 aa14.57□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.56□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 FOSBP53539 338 aa14.56□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.56□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.56□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 WNT2BQ93097 391 aa14.56□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 ADCY9O60503 1353 aa14.56□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.55□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.55□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.55□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.55□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 NECTIN2Q92692 538 aa14.55□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.55□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.55□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 ST5P78524 1137 aa14.54□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.54□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.54□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 IL16Q14005 1332 aa14.54□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.54□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 SBF1O95248 1867 aa14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 CACNA1SQ13698 1873 aa14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 H0YIN7 160 aa14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 PTPREP23469 700 aa14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 PDE6BP35913 854 aa14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 COPS6Q7L5N1 327 aa14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.53□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.52□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 ABCC12Q96J65 1359 aa14.52□□□□□ -0.08
SMAD4-211ENST00000590499 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.52□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 SLX4Q8IY92 1834 aa14.52□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 SRGNP10124 158 aa14.51□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 GPTP24298 496 aa14.51□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 TSPYL6Q8N831 410 aa14.51□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 TTLL6Q8N841 843 aa14.51□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 FAM177BA6PVY3 158 aa14.5□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 NPHP1O15259 732 aa14.5□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 NTSR2O95665 410 aa14.5□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 SUSD4Q5VX71 490 aa14.5□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 STYK1Q6J9G0 422 aa14.5□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.5□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 WDR63Q8IWG1 891 aa14.5□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 NYXQ9GZU5 481 aa14.5□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.5□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 MAP3K9P80192 1104 aa14.49□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SMAD4-211ENST00000590499 PARP10Q53GL7 1025 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms