RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PBRM1Q86U86 1689 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FZD6O60353 706 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BMP4P12644 408 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLC30A3Q99726 388 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MBIPQ9NS73 344 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PDGFAP04085 211 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPEM2Q0P670 501 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM182BQ5T319 152 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 POLIQ9UNA4 740 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 XYLBO75191 536 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CCINQ13939 588 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GSX2Q9BZM3 304 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGF1RP08069 1367 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SASH3O75995 380 aa9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PCSK2P16519 638 aa9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C8orf34Q49A92 452 aa9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BHMTQ93088 406 aa9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.21□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A6NHS1 94 aa9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NDUFB5O43674 189 aa9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PNMA5Q96PV4 448 aa9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GRIN2BQ13224 1484 aa9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADAMTS2O95450 1211 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EGFRP00533 1210 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAP2K3P46734 347 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TTC16Q8NEE8 873 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NFKB1P19838 968 aa9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAPK1P28482 360 aa9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SYT9Q86SS6 491 aa9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMC1Q8TDI8 760 aa9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZFATQ9P243 1243 aa9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARHGEF11O15085 1522 aa9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP5P45974 858 aa9.18□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADAMTS12P58397 1594 aa9.18□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NEUROD1Q13562 356 aa9.18□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KLF15Q9UIH9 416 aa9.18□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RARAP10276 462 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NLRP13Q86W25 1043 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GJD3Q8N144 294 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGFLR1Q9H665 355 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ELP3Q9H9T3 547 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GGA1Q9UJY5 639 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CEP170Q5SW79 1584 aa9.16□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SYNJ2O15056 1496 aa9.16□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.16□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARAFP10398 606 aa9.16□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ACDQ96AP0 544 aa9.16□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.16□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa9.15□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARAP1Q96P48 1450 aa9.15□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLURP2P0DP57 97 aa9.15□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADH6P28332 368 aa9.15□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CITED4Q96RK1 184 aa9.15□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.15□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MMP20O60882 483 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EHHADHQ08426 723 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PDE3BQ13370 1112 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CCDC27Q2M243 656 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMC7Q7Z402 723 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM129BQ96TA1 746 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EFCC1Q9HA90 598 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms