RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587586.5

GTF3C2-AS1-204, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 529 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ATP8B2P98198 1209 aa8.02□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.02□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.02□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.02□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.02□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 COL4A1P02462 1669 aa8.02□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FAM177BA6PVY3 158 aa8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GNAI2P04899 355 aa8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 POLA2Q14181 598 aa8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CNBD1Q8NA66 436 aa8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SSH3Q8TE77 659 aa8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SRGNP10124 158 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TGFB2P61812 414 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CEP85Q6P2H3 762 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LMBR1LQ6UX01 489 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NLRP3Q96P20 1036 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 POLD1P28340 1107 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PDE6BP35913 854 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CTSWP56202 376 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GREM2Q9H772 168 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 COPRSQ9NQ92 184 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PCNTO95613 3336 aa7.98□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ST5P78524 1137 aa7.98□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 STYK1Q6J9G0 422 aa7.98□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.98□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.98□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SLX4Q8IY92 1834 aa7.98□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SNED1Q8TER0 1413 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BBOX1O75936 387 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IGHDP01880 384 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NPR1P16066 1061 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DPEP1P16444 411 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CHRNA5P30532 468 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GPR162Q16538 588 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MASTLQ96GX5 879 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DCTPP1Q9H773 170 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FBXO3Q9UK99 471 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.97□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 A0A0G2JLW4 131 aa7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 H0YIN7 160 aa7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ITGA6P23229 1130 aa7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GRAPQ13588 217 aa7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FAM161AQ3B820 660 aa7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SP8Q8IXZ3 490 aa7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 A0A1B0GUL6 1792 aa7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LTBP1Q14766 1721 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SRGAP3O43295 1099 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CIAO1O76071 339 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SASH1O94885 1247 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ALDH1B1P30837 517 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SMC5Q8IY18 1101 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CNKSR1Q969H4 720 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SPEF2Q9C093 1822 aa7.94□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CACNA1SQ13698 1873 aa7.94□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 EYA2O00167 538 aa7.94□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HSPA6P17066 643 aa7.94□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms