RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-210	ENST00000578916		H7C1D1	291 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPRM-210	ENST00000578916	PARP10	Q53GL7	1025 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPRM-210	ENST00000578916	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
PTPRM-210	ENST00000578916	MPND	Q8N594	471 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPRM-210	ENST00000578916	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPRM-210	ENST00000578916	ZIC5	Q96T25	663 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPRM-210	ENST00000578916	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
PTPRM-210	ENST00000578916	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
PTPRM-210	ENST00000578916	ABCC4	O15439	1325 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPRM-210	ENST00000578916	BBOX1	O75936	387 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	SOX10	P56693	466 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	SP8	Q8IXZ3	490 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	NEFM	P07197	916 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	RGMB	Q6NW40	437 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	MICALL2	Q8IY33	904 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	CCDC102A	Q96A19	550 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	SHTN1	A0MZ66	631 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	YDJC	A8MPS7	323 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	TRPA1	O75762	1119 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	PPP2R1A	P30153	589 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	DLK2	Q6UY11	383 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	DPF2	Q92785	391 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	ERBB4	Q15303	1308 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	NUP98	P52948	1817 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	GRAP	Q13588	217 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	RNF186	Q9NXI6	227 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	PSMD14	O00487	310 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	TMC4	Q7Z404	712 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PTPRM-210	ENST00000578916	ADM5	C9JUS6	153 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	WASHC4	Q2M389	1173 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	RIMBP2	O15034	1052 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	SLC10A3	P09131	477 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	NLRP10	Q86W26	655 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	CSRNP1	Q96S65	589 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	C6orf229	H3BNL8	230 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	EGFR	P00533	1210 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	ANXA1	P04083	346 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	PDIA6	Q15084	440 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	NFE2L2	Q16236	605 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	SULF1	Q8IWU6	871 aa		12	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	EYA3	Q99504	573 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	ECE2	O60344	883 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	GPSM2	P81274	684 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	ZNF428	Q96B54	188 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRM-210	ENST00000578916		G3V3G9	751 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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