RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577760.1

RPL23-208, Transcript of ribosomal protein L23, human

Gene RPL23, Length 3,081 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL23-208	ENST00000577760	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	MAP3K5	Q99683	1374 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	PTPN21	Q16825	1174 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	SMC2	O95347	1197 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	ME1	P48163	572 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	TEF	Q10587	303 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	TERF2	Q15554	542 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	SASH1	O94885	1247 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	IQCB1	Q15051	598 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	CHST3	Q7LGC8	479 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	USP6	P35125	1406 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	SDF4	Q9BRK5	362 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	TMX1	Q9H3N1	280 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	BTBD11	A6QL63	1104 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	HOXC9	P31274	260 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	REST	Q13127	1097 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	ANKRD1	Q15327	319 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	TMC6	Q7Z403	805 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	SUCLG2	Q96I99	432 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	SBNO1	A3KN83	1393 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	STX1A	Q16623	288 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	HOMER1	Q86YM7	354 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	ABTB2	Q8N961	1025 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	FSIP1	Q8NA03	581 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	USP28	Q96RU2	1077 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	C3	P01024	1663 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	CCZ1B	P86790	482 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	NEK1	Q96PY6	1258 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760		A0A1B0GVL5	298 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	ITSN1	Q15811	1721 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	APOBR	Q0VD83	1088 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	CFAP45	Q9UL16	551 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	SCRN1	Q12765	414 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	ADCY9	O60503	1353 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RPL23-208	ENST00000577760	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	SYCP1	Q15431	976 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	TMEM51	Q9NW97	253 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	MYL6B	P14649	208 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	ERO1A	Q96HE7	468 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	EPC1	Q9H2F5	836 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	IFNK	Q9P0W0	207 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	KDR	P35968	1356 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	TAF5L	O75529	589 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	KCNB2	Q92953	911 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760		A0A0G2JLW4	131 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	KCNA4	P22459	653 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPL23-208	ENST00000577760	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37

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