RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 H7C1W4 665 aa13.86□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 DBN1Q16643 649 aa13.86□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa13.86□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 PGBD3Q8N328 593 aa13.86□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 VTI1AQ96AJ9 217 aa13.86□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTPRKQ15262 1439 aa13.86□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 LBRQ14739 615 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL26A1Q96A83 441 aa13.85□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZIC5Q96T25 663 aa13.85□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALKQ9UM73 1620 aa13.83□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 THBS1P07996 1170 aa13.83□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 VSIG8P0DPA2 414 aa13.83□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa13.83□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.83□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.83□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZMYM3Q14202 1370 aa13.83□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 A2MP01023 1474 aa13.82□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.82□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PNR3 127 aa13.82□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 EFHC2Q5JST6 749 aa13.82□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 BICDL1Q6ZP65 573 aa13.82□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 VWA5B2Q8N398 1253 aa13.82□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 NGLY1Q96IV0 654 aa13.82□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.81□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDC14CA4D256 554 aa13.81□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 RTN1Q16799 776 aa13.81□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa13.81□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 NLRP8Q86W28 1048 aa13.81□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 RHPN1Q8TCX5 695 aa13.81□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 MKNK1Q9BUB5 465 aa13.81□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.8□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.8□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 CPS1P31327 1500 aa13.8□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 TIAM1Q13009 1591 aa13.8□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAPN12Q6ZSI9 719 aa13.8□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 SV2AQ7L0J3 742 aa13.8□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYO19Q96H55 970 aa13.8□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.79□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLRG1Q96E93 195 aa13.79□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERBB4Q15303 1308 aa13.78□□□□□ -0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 DEPDC5O75140 1603 aa13.77□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 IRF7Q92985 503 aa13.77□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.76□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 WFS1O76024 890 aa13.76□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCNN1AP37088 669 aa13.76□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYNMO15061 1565 aa13.75□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 HIF1AQ16665 826 aa13.75□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 FIGNL1Q6PIW4 674 aa13.75□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 TREML4Q6UXN2 200 aa13.75□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa13.75□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 GJA3Q9Y6H8 435 aa13.75□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.75□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 PZPP20742 1482 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 MBD5Q9P267 1494 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 COX20Q5RI15 118 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 LCE2CQ5TA81 110 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 SAMD5Q5TGI4 173 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXR1Q6PIV2 292 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 SUSD3Q96L08 255 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAIPQ9BWF2 469 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 SAP130Q9H0E3 1048 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 NEUROD4Q9HD90 331 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEPT3Q9UH03 358 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRFN2Q9ULH4 789 aa13.74□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.73□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 C16orf46Q6P387 395 aa13.73□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF280CQ8ND82 737 aa13.73□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSH2DQ96JZ2 352 aa13.73□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.73□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 IQGAP1P46940 1657 aa13.72□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDFIP2Q9NV92 336 aa13.72□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLK14Q9P0G3 267 aa13.72□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa13.72□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.72□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 BRD1O95696 1058 aa13.71□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 DGKZQ13574 1117 aa13.71□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 C11orf91Q3C1V1 193 aa13.71□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRERF1Q96PN7 1200 aa13.71□□□□□ -0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 MED14O60244 1454 aa13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms