RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 CRY2Q49AN0 593 aa23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 GREM2Q9H772 168 aa23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 TAF1P21675 1872 aa23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHRNA5P30532 468 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM161AQ3B820 660 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP85Q6P2H3 762 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.33■■□□□ 1.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.33■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 SRGNP10124 158 aa23.33■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP8B2P98198 1209 aa23.33■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTX1Q13505 466 aa23.33■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 AAMPQ13685 434 aa23.33■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.33■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.33■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL4A1P02462 1669 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 H0YIN7 160 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A0G2JLW4 131 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 SRGAP3O43295 1099 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 ITGA6P23229 1130 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 RTL9Q8NET4 1388 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPR1P16066 1061 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 DPEP1P16444 411 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRP5O75197 1615 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 TGFB2P61812 414 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 MASTLQ96GX5 879 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNA3P22001 575 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLA2Q14181 598 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 CACNA1SQ13698 1873 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 SSH3Q8TE77 659 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPEF2Q9C093 1822 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 STYK1Q6J9G0 422 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRAPQ13588 217 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 SYT17Q9BSW7 474 aa23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLX4Q8IY92 1834 aa23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 HMMRO75330 724 aa23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 ALDH1B1P30837 517 aa23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC51AQ86UW1 340 aa23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNKSR1Q969H4 720 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 SIL1Q9H173 461 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 COPRSQ9NQ92 184 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIM2Q9P1W9 311 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 BBOX1O75936 387 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGHDP01880 384 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRC24Q50LG9 513 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTLL6Q8N841 843 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 EYA2O00167 538 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 OLFM4Q6UX06 510 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-203ENST00000559737 DCTPP1Q9H773 170 aa23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms