RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 SUPT20HQ8NEM7 779 aa15.04■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.03■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.03■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 CA12O43570 354 aa15.03■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 AOC2O75106 756 aa15.03■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 PDIA6Q15084 440 aa15.03■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 CFAP44Q96MT7 982 aa15.03■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 ABCC4O15439 1325 aa15.02■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 BBOX1O75936 387 aa15.02■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 CELF2O95319 508 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 HOXB7P09629 217 aa15.02■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 GRM1Q13255 1194 aa15.02■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 SP8Q8IXZ3 490 aa15.02■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CS-221ENST00000550734 LAMB2P55268 1798 aa15.02□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 CCDC85CA6NKD9 419 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 APAF1O14727 1248 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 ZNF853P0CG23 659 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 CIAPIN1Q6FI81 312 aa15□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 TSKSQ9UJT2 592 aa15□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 TNIP1Q15025 636 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 CCDC184Q52MB2 194 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 MPNDQ8N594 471 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 IFT57Q9NWB7 429 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 YDJCA8MPS7 323 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 GNAI1P63096 354 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 CCDC27Q2M243 656 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 PROSER3Q2NL68 480 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 NLRP10Q86W26 655 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 TAF1P21675 1872 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 ANP32CO43423 234 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 RAD17O75943 681 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 GRAPQ13588 217 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 KRT24Q2M2I5 525 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 TMC4Q7Z404 712 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 MBIPQ9NS73 344 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-221ENST00000550734 H7C1D1 291 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 NOGQ13253 232 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 TCIRG1Q13488 830 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 COPS6Q7L5N1 327 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 DPF2Q92785 391 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 SHTN1A0MZ66 631 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 ANXA1P04083 346 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 ZIC5Q96T25 663 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 USP48Q86UV5 1035 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 MICALL2Q8IY33 904 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 HUNKP57058 714 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 DGKZQ13574 1117 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 MRS2Q9HD23 443 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 HYPKQ9NX55 129 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 PSMD14O00487 310 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 WASHC4Q2M389 1173 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 NECTIN2Q92692 538 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 RGMBQ6NW40 437 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-221ENST00000550734 DLK2Q6UY11 383 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms