RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543656.1

RUSC1-AS1-204, RUSC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RUSC1-AS1, Length 1,357 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GRM1Q13255 1194 aa21.65■■□□□ 1.06
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CAPNS2Q96L46 248 aa21.65■■□□□ 1.06
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TSKSQ9UJT2 592 aa21.65■■□□□ 1.06
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.64■■□□□ 1.06
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GPC2Q8N158 579 aa21.64■■□□□ 1.06
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 COL4A5P29400 1685 aa21.64■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.63■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.63■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.63■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.63■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.63■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RGL2O15211 777 aa21.62■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.62■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SYNE4Q8N205 404 aa21.62■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.62■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.62■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MS4A1P11836 297 aa21.61■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KSR2Q6VAB6 950 aa21.61■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SNED1Q8TER0 1413 aa21.61■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.61■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PDE3AQ14432 1141 aa21.61■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.61■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.61■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ECE1P42892 770 aa21.6■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.6■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.59■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FAM177BA6PVY3 158 aa21.59■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TRAF5O00463 557 aa21.59■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TRIM27P14373 513 aa21.59■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.59■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.59■■□□□ 1.05
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PLIN1O60240 522 aa21.58■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 AOC2O75106 756 aa21.58■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SCNN1DP51172 638 aa21.58■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CST9Q5W186 159 aa21.58■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.58■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 EPS15P42566 896 aa21.57■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.57■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.57■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 JDP2Q8WYK2 163 aa21.57■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.57■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.56■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.56■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.56■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.56■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.56■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ALDH1B1P30837 517 aa21.55■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PSMD1Q99460 953 aa21.55■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.55■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ABCC4O15439 1325 aa21.55■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SLC51AQ86UW1 340 aa21.54■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 F6X3S4 739 aa21.53■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.53■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ABCC12Q96J65 1359 aa21.53■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TCIRG1Q13488 830 aa21.52■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 BEND3Q5T5X7 828 aa21.52■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TNNQ9UQP3 1299 aa21.52■■□□□ 1.04
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MAP2K2P36507 400 aa21.51■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HLFQ16534 295 aa21.51■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RLBP1P12271 317 aa21.5■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LINS1Q8NG48 757 aa21.5■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.5■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.5■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ALDH1L1O75891 902 aa21.49■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.49■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CRY2Q49AN0 593 aa21.49■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.49■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.49■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.49■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.49■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NUP98P52948 1817 aa21.49■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.48■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.48■■□□□ 1.03
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms