RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 POLA2Q14181 598 aa9.81□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 CRY2Q49AN0 593 aa9.81□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.81□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 CNBD1Q8NA66 436 aa9.81□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 NYXQ9GZU5 481 aa9.81□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 NUP98P52948 1817 aa9.81□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.81□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 FAM177BA6PVY3 158 aa9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 DPEP1P16444 411 aa9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 CTSWP56202 376 aa9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 TGFB2P61812 414 aa9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 ATP8B2P98198 1209 aa9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 SSH3Q8TE77 659 aa9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 BCS1LQ9Y276 419 aa9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.8□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.79□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 PDE8AO60658 829 aa9.79□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.79□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.79□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.79□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.79□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.79□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 COL4A1P02462 1669 aa9.78□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 IGHDP01880 384 aa9.78□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 FAM161AQ3B820 660 aa9.78□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.78□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.78□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 LAMB2P55268 1798 aa9.78□□□□□ -0.84
C16orf62-211ENST00000540101 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 KIF3CO14782 793 aa9.77□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 SRGAP3O43295 1099 aa9.77□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 KCNA3P22001 575 aa9.77□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.77□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 GREM2Q9H772 168 aa9.77□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 COPRSQ9NQ92 184 aa9.77□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 HSPA6P17066 643 aa9.76□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 ST5P78524 1137 aa9.76□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 SMC5Q8IY18 1101 aa9.76□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 DCTPP1Q9H773 170 aa9.76□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 SRGNP10124 158 aa9.75□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 ITGA6P23229 1130 aa9.75□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 CHRNA5P30532 468 aa9.75□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.75□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 KLHDC4Q8TBB5 520 aa9.75□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 NLRP3Q96P20 1036 aa9.75□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.75□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 HMMRO75330 724 aa9.74□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.74□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.74□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 PIM2Q9P1W9 311 aa9.74□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 CIAO1O76071 339 aa9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 PDE6BP35913 854 aa9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 SLC51AQ86UW1 340 aa9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 FBXO3Q9UK99 471 aa9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 SNED1Q8TER0 1413 aa9.73□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 EYA2O00167 538 aa9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 SASH1O94885 1247 aa9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 NPR1P16066 1061 aa9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 GRAPQ13588 217 aa9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 LRRC24Q50LG9 513 aa9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 GCC1Q96CN9 775 aa9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
C16orf62-211ENST00000540101 NPHP1O15259 732 aa9.71□□□□□ -0.86
C16orf62-211ENST00000540101 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms