RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520945.5

STAU2-209, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 4

Gene STAU2, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-209	ENST00000520945	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	KDM6B	O15054	1643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ARHGEF11	O15085	1522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CFTR	P13569	1480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CDC25B	P30305	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	LMAN1	P49257	510 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GSDMD	P57764	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	BIRC2	Q13490	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ELF2	Q15723	593 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	RDH13	Q8NBN7	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SENP2	Q9HC62	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CEP170	Q5SW79	1584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	DAPK1	P53355	1430 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945		A0A1B0GUA9	196 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	APAF1	O14727	1248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TRIM66	O15016	1216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GPR37	O15354	613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SGSM2	O43147	1006 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	NR1I2	O75469	434 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ERLIN1	O75477	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PTGS1	P23219	599 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GYS2	P54840	703 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CORO7	P57737	925 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	NEDD9	Q14511	834 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SULF1	Q8IWU6	871 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	IGF1R	P08069	1367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	NEBL	O76041	1014 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ERLIN2	O94905	339 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	BRD1	O95696	1058 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	TUBB	P07437	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	FECH	P22830	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ANAPC15	P60006	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	MLEC	Q14165	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STAU2-209	ENST00000520945	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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